More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0606 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  77.6 
 
 		 576 aa  865    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 574 aa  1134    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  78.3 
 
 		 592 aa  895    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  77.95 
 
 		 575 aa  875    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  78.47 
 
 		 574 aa  884    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  88.3 
 
 		 581 aa  971    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  47.77 
 
 		 578 aa  455  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  48.1 
 
 		 571 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  28.68 
 
 		 565 aa  236  7e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 		 566 aa  225  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 566 aa  223  9e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 		 566 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  31.98 
 
 		 546 aa  205  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  30.93 
 
 		 595 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  29.22 
 
 		 541 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  31.41 
 
 		 551 aa  194  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  30.29 
 
 		 547 aa  193  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  30.29 
 
 		 547 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  30.17 
 
 		 720 aa  192  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 		 548 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  30.43 
 
 		 572 aa  190  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 		 562 aa  189  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  31.39 
 
 		 561 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  29.24 
 
 		 575 aa  187  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 		 572 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  29.11 
 
 		 558 aa  179  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  29.61 
 
 		 566 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 		 773 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  27.05 
 
 		 682 aa  174  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  26.74 
 
 		 656 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 		 688 aa  170  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  28.25 
 
 		 771 aa  170  8e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  25.04 
 
 		 666 aa  169  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.71 
 
 		 663 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  28.96 
 
 		 561 aa  169  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  27.83 
 
 		 666 aa  169  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  26.03 
 
 		 672 aa  167  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 		 762 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.61 
 
 		 697 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  30.64 
 
 		 566 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 		 665 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 		 665 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  26.44 
 
 		 741 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  32.58 
 
 		 424 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 		 577 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 		 775 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  27.22 
 
 		 674 aa  162  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  27.43 
 
 		 650 aa  159  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 		 668 aa  158  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  31.27 
 
 		 659 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 673 aa  157  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  25.97 
 
 		 582 aa  156  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 		 693 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  31.18 
 
 		 659 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 		 585 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 		 665 aa  154  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  26.86 
 
 		 586 aa  154  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  25.84 
 
 		 584 aa  154  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  24.86 
 
 		 665 aa  153  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.14 
 
 		 671 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.11 
 
 		 670 aa  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  28.42 
 
 		 671 aa  151  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  28.02 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  25.28 
 
 		 666 aa  150  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  26.82 
 
 		 658 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 		 584 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 		 659 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 		 636 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  25.05 
 
 		 664 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 		 567 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  27.55 
 
 		 581 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  29.03 
 
 		 660 aa  144  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.23 
 
 		 567 aa  144  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  32.35 
 
 		 598 aa  144  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  27.55 
 
 		 567 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  26.4 
 
 		 662 aa  141  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  30.08 
 
 		 620 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  26.41 
 
 		 666 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0188  sodium/hydrogen exchanger  28.86 
 
 		 624 aa  140  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.86 
 
 		 621 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  23.28 
 
 		 658 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.63 
 
 		 620 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  27.5 
 
 		 556 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  26.14 
 
 		 674 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.81 
 
 		 669 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.63 
 
 		 620 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.63 
 
 		 620 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.14 
 
 		 659 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  30.25 
 
 		 620 aa  137  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  30.25 
 
 		 620 aa  136  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.63 
 
 		 620 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.73 
 
 		 620 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  29.1 
 
 		 620 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  27.76 
 
 		 660 aa  136  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.73 
 
 		 620 aa  136  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.73 
 
 		 620 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.1 
 
 		 620 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  29.73 
 
 		 620 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.73 
 
 		 620 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  28.87 
 
 		 664 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>