More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1997 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 576 aa  1130    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  77.6 
 
 		 574 aa  866    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  84.72 
 
 		 592 aa  965    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  76.91 
 
 		 575 aa  877    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  85.07 
 
 		 574 aa  966    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  78.5 
 
 		 581 aa  867    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  48.28 
 
 		 578 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  49.31 
 
 		 571 aa  479  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  27.52 
 
 		 565 aa  243  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 		 566 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 		 551 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 		 566 aa  230  5e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 566 aa  229  9e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  32.84 
 
 		 595 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 		 546 aa  220  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  31.18 
 
 		 558 aa  207  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  29.08 
 
 		 541 aa  202  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  32.34 
 
 		 720 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  28.36 
 
 		 548 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  31.17 
 
 		 572 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  30.8 
 
 		 547 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  30.8 
 
 		 547 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 		 572 aa  193  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 		 562 aa  193  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  31.32 
 
 		 773 aa  193  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  31.15 
 
 		 575 aa  190  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  27.41 
 
 		 666 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  30.45 
 
 		 561 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  27.65 
 
 		 741 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  31.01 
 
 		 771 aa  182  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  34.22 
 
 		 424 aa  182  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.23 
 
 		 663 aa  180  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  32.05 
 
 		 566 aa  178  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 		 561 aa  177  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 		 577 aa  177  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  28.11 
 
 		 650 aa  177  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  29.04 
 
 		 566 aa  177  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  26.76 
 
 		 666 aa  176  8e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.31 
 
 		 697 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  29.96 
 
 		 775 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  25.22 
 
 		 672 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  28.22 
 
 		 665 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  28.22 
 
 		 665 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 		 762 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 		 656 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  27.55 
 
 		 674 aa  171  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  26.68 
 
 		 665 aa  170  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  29.68 
 
 		 668 aa  170  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  26.78 
 
 		 636 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 		 688 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  26.86 
 
 		 586 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  27.07 
 
 		 666 aa  163  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  28.07 
 
 		 585 aa  164  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  26.16 
 
 		 682 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  30.43 
 
 		 659 aa  161  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  25.28 
 
 		 658 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  27.21 
 
 		 581 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  28.86 
 
 		 673 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 		 664 aa  157  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 		 659 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.87 
 
 		 671 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  27.23 
 
 		 575 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 		 567 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  28.67 
 
 		 670 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  28.42 
 
 		 671 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  27.66 
 
 		 584 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  26.74 
 
 		 556 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  25.59 
 
 		 665 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  30.91 
 
 		 659 aa  154  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 		 584 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.33 
 
 		 567 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1573  potassium efflux system protein  28.15 
 
 		 574 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566024  hitchhiker  0.00174372 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 		 598 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 		 666 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  28.96 
 
 		 567 aa  151  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  28.62 
 
 		 693 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  27.64 
 
 		 584 aa  151  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  27.32 
 
 		 582 aa  150  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.19 
 
 		 588 aa  150  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  26.67 
 
 		 555 aa  150  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  25.97 
 
 		 658 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3563  putative potassium efflux transporter (ybaL)  27.19 
 
 		 585 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  27.67 
 
 		 567 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  24.82 
 
 		 664 aa  146  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.43 
 
 		 621 aa  146  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  28.77 
 
 		 457 aa  146  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  27.45 
 
 		 660 aa  145  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 		 606 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0188  sodium/hydrogen exchanger  28.03 
 
 		 624 aa  144  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  27.89 
 
 		 573 aa  143  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  30.81 
 
 		 620 aa  143  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 		 542 aa  143  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  30 
 
 		 620 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  28.87 
 
 		 576 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  25.44 
 
 		 613 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  27.58 
 
 		 676 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  30.63 
 
 		 620 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 		 584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  30.63 
 
 		 620 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  27.63 
 
 		 558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>