More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0610 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 542 aa  1082    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  56.84 
 
 		 528 aa  614  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000149336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  53.37 
 
 		 524 aa  577  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02051  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  59.84 
 
 		 545 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00514196  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.4 
 
 		 553 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004131  putative Glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  45.99 
 
 		 529 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0537  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  45.94 
 
 		 535 aa  430  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  0.013329 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01333  hypothetical protein  46.56 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0828  sodium/hydrogen antiporter  44.66 
 
 		 527 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0513  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  45.79 
 
 		 528 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0415  sodium/hydrogen exchanger  43.24 
 
 		 559 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3267  sodium/hydrogen exchanger  43.31 
 
 		 542 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.389403  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0653  sodium/hydrogen exchanger  43.07 
 
 		 544 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1189  sodium/hydrogen exchanger  44.96 
 
 		 534 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3667  sodium/hydrogen exchanger  42.64 
 
 		 556 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2640  sodium/hydrogen exchanger  44.12 
 
 		 535 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3248  sodium/hydrogen exchanger  45.12 
 
 		 547 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4016  sodium/hydrogen exchanger  43.82 
 
 		 541 aa  398  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000212571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3407  sodium/hydrogen exchanger  44.55 
 
 		 545 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.792145  normal  0.0393803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0545  sodium/hydrogen exchanger  44.36 
 
 		 545 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408022  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3577  sodium/hydrogen exchanger  44.72 
 
 		 547 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0635  sodium/hydrogen exchanger  44.19 
 
 		 551 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3727  sodium/hydrogen exchanger  44.19 
 
 		 551 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1223  sodium/hydrogen exchanger  42.72 
 
 		 531 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0693873  normal  0.0816945 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0662  sodium/hydrogen exchanger  44.19 
 
 		 551 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0658  sodium/hydrogen exchanger  44.19 
 
 		 551 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0582  sodium/hydrogen exchanger  44.17 
 
 		 552 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0695  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  44.15 
 
 		 547 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3453  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 		 523 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  40.31 
 
 		 520 aa  270  5.9999999999999995e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  25.94 
 
 		 565 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  24.07 
 
 		 658 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  28.55 
 
 		 562 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  24.9 
 
 		 672 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  25.84 
 
 		 566 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  25.37 
 
 		 592 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  25.05 
 
 		 566 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  24.24 
 
 		 566 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  27.41 
 
 		 589 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  28.52 
 
 		 562 aa  143  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.09 
 
 		 575 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  26.76 
 
 		 595 aa  140  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  27.93 
 
 		 562 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  27.22 
 
 		 589 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  27.88 
 
 		 563 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.03 
 
 		 589 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  25.09 
 
 		 574 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  27.1 
 
 		 589 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 		 576 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  25.89 
 
 		 650 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  26.74 
 
 		 589 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1236  potassium efflux system protein  26.55 
 
 		 589 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  24.31 
 
 		 571 aa  136  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  27.7 
 
 		 563 aa  136  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  26.43 
 
 		 661 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  26.43 
 
 		 661 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 		 551 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3045  potassium efflux system protein  27.41 
 
 		 589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.268966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  27.5 
 
 		 555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1305  potassium efflux system protein  27.41 
 
 		 589 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00534275  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  29.24 
 
 		 558 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  26.41 
 
 		 572 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  26.7 
 
 		 556 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  27.39 
 
 		 563 aa  133  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.09 
 
 		 663 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  24.46 
 
 		 662 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1341  potassium efflux system protein  26.94 
 
 		 589 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92723  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.19 
 
 		 655 aa  130  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  26.65 
 
 		 575 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1380  sodium/hydrogen exchanger  25.14 
 
 		 540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.034971  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.15 
 
 		 620 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  29.05 
 
 		 561 aa  128  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  27.24 
 
 		 561 aa  128  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  26.36 
 
 		 548 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  26.64 
 
 		 546 aa  127  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  27.24 
 
 		 561 aa  127  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.95 
 
 		 620 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  24.26 
 
 		 574 aa  126  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  22.97 
 
 		 666 aa  126  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  26.53 
 
 		 577 aa  126  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 		 541 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  27.22 
 
 		 561 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.76 
 
 		 620 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  24.77 
 
 		 673 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  26.13 
 
 		 649 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.76 
 
 		 620 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.76 
 
 		 620 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  28.05 
 
 		 666 aa  123  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  26 
 
 		 606 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.42 
 
 		 620 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  26.63 
 
 		 572 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 581 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  23.59 
 
 		 665 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.99 
 
 		 621 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 		 606 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  26.22 
 
 		 620 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 		 566 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.22 
 
 		 620 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  22.71 
 
 		 666 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.22 
 
 		 620 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>