More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1614 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  89.45 
 
 		 561 aa  961    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 566 aa  1115    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  67.56 
 
 		 562 aa  742    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  61.52 
 
 		 575 aa  630  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  60.7 
 
 		 572 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  54.87 
 
 		 558 aa  578  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  55.68 
 
 		 541 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  55.83 
 
 		 572 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  57.94 
 
 		 561 aa  561  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  72.32 
 
 		 424 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  50.28 
 
 		 595 aa  497  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 		 546 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  49.34 
 
 		 551 aa  482  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  47.79 
 
 		 548 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  48.19 
 
 		 547 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  48.01 
 
 		 547 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  45.97 
 
 		 720 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  38.69 
 
 		 566 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  38.5 
 
 		 566 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  38.5 
 
 		 566 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  44.38 
 
 		 566 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  38 
 
 		 565 aa  353  5e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  28.88 
 
 		 577 aa  224  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  29.68 
 
 		 592 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  30.87 
 
 		 571 aa  217  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.5 
 
 		 575 aa  217  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  29.13 
 
 		 574 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  28.96 
 
 		 578 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  29.13 
 
 		 574 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  28.68 
 
 		 576 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  28.04 
 
 		 674 aa  193  7e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  26.69 
 
 		 567 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 		 581 aa  181  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.61 
 
 		 567 aa  178  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.18 
 
 		 648 aa  178  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  27.26 
 
 		 567 aa  178  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 		 658 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.55 
 
 		 671 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  27.88 
 
 		 662 aa  171  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  27.22 
 
 		 584 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 		 668 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  28.36 
 
 		 584 aa  166  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.57 
 
 		 720 aa  166  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  27.73 
 
 		 649 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.19 
 
 		 579 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  26.74 
 
 		 653 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 		 656 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.36 
 
 		 697 aa  164  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0188  sodium/hydrogen exchanger  25.89 
 
 		 624 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  28 
 
 		 661 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  29.96 
 
 		 672 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  26.07 
 
 		 648 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 		 636 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 		 666 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  28.31 
 
 		 598 aa  161  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  28.21 
 
 		 650 aa  160  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  26.44 
 
 		 648 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  26.44 
 
 		 648 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  26.56 
 
 		 649 aa  160  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  25.93 
 
 		 648 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  28.06 
 
 		 660 aa  159  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  28.04 
 
 		 673 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  28.49 
 
 		 666 aa  159  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  27.45 
 
 		 664 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  28.19 
 
 		 682 aa  158  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  26.23 
 
 		 775 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  26.55 
 
 		 598 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 		 741 aa  158  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  27.18 
 
 		 674 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  27.06 
 
 		 586 aa  156  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 		 671 aa  156  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  26.03 
 
 		 649 aa  156  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  25.91 
 
 		 575 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  27.73 
 
 		 660 aa  155  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  24.51 
 
 		 648 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  24.31 
 
 		 648 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  24.31 
 
 		 648 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  25.81 
 
 		 762 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.73 
 
 		 659 aa  153  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  28.51 
 
 		 678 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  29.76 
 
 		 665 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  28.66 
 
 		 663 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  27.34 
 
 		 585 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 		 457 aa  151  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 		 668 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  26.69 
 
 		 667 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  24.51 
 
 		 648 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.81 
 
 		 669 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  28.81 
 
 		 669 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.81 
 
 		 669 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.81 
 
 		 669 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.81 
 
 		 669 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  25.14 
 
 		 556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.81 
 
 		 669 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  28.31 
 
 		 666 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  28.66 
 
 		 663 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  27.2 
 
 		 667 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  27.22 
 
 		 664 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  26.27 
 
 		 666 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 		 668 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>