More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1095 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  63.07 
 
 
575 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  67.56 
 
 
566 aa  728    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  67.62 
 
 
561 aa  727    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
562 aa  1112    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  58.14 
 
 
572 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  56.9 
 
 
541 aa  594  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  55.94 
 
 
572 aa  565  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  54.46 
 
 
558 aa  561  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  56.86 
 
 
561 aa  560  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  76.76 
 
 
424 aa  552  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  49.17 
 
 
595 aa  506  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  51.96 
 
 
551 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  49.64 
 
 
546 aa  485  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  46.46 
 
 
547 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  46.28 
 
 
547 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  45.04 
 
 
548 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  46.69 
 
 
720 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  46.88 
 
 
566 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  39.07 
 
 
566 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  39.44 
 
 
566 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  39.2 
 
 
565 aa  362  8e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  39.07 
 
 
566 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.2 
 
 
575 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  30.55 
 
 
571 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  28.39 
 
 
574 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  28.26 
 
 
577 aa  213  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 
592 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 
576 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  29.25 
 
 
574 aa  206  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  30.45 
 
 
578 aa  204  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  26.94 
 
 
648 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  26.94 
 
 
648 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  25.58 
 
 
648 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  27.02 
 
 
648 aa  180  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  28.27 
 
 
581 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  25.93 
 
 
648 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  27.09 
 
 
650 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  25.93 
 
 
648 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  25.93 
 
 
648 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  27.37 
 
 
682 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.77 
 
 
720 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  26.15 
 
 
648 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  26 
 
 
775 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  27.14 
 
 
567 aa  174  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  27.76 
 
 
567 aa  171  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  24.86 
 
 
648 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  27.14 
 
 
674 aa  170  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.01 
 
 
567 aa  169  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  25.56 
 
 
649 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 
666 aa  167  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  24.25 
 
 
649 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  25.9 
 
 
657 aa  166  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 
762 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  28.38 
 
 
584 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 
664 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.57 
 
 
579 aa  163  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  26.06 
 
 
584 aa  163  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  26.07 
 
 
653 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  29.54 
 
 
598 aa  162  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  25.52 
 
 
636 aa  161  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  28.96 
 
 
656 aa  160  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  25.61 
 
 
649 aa  160  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  30.33 
 
 
520 aa  159  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  25.31 
 
 
771 aa  159  9e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  25.15 
 
 
650 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0188  sodium/hydrogen exchanger  26.64 
 
 
624 aa  157  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  29.13 
 
 
542 aa  157  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  25.61 
 
 
562 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 
741 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  27.12 
 
 
662 aa  156  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  26.3 
 
 
658 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  28.91 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  26.72 
 
 
563 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.96 
 
 
670 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  26.44 
 
 
598 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.34 
 
 
654 aa  153  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  26.52 
 
 
563 aa  152  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  26.75 
 
 
674 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  25.23 
 
 
773 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  24.18 
 
 
671 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  27.39 
 
 
656 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  26.45 
 
 
556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  26.57 
 
 
666 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  25.89 
 
 
583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 
659 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  28.81 
 
 
663 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  28.24 
 
 
660 aa  147  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  27.62 
 
 
660 aa  147  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  28.03 
 
 
666 aa  146  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  24.9 
 
 
563 aa  146  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.52 
 
 
697 aa  146  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  27.33 
 
 
566 aa  146  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.45 
 
 
663 aa  146  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  27.39 
 
 
528 aa  146  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000149336 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  27.27 
 
 
561 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 
606 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  26 
 
 
672 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  26.15 
 
 
575 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.99 
 
 
669 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  26.39 
 
 
562 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>