41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3620 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3620  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 412 aa  805    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  28.46 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1412  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.15 
 
 		 574 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1689  sodium/hydrogen exchanger  27.8 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  30.36 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1539  sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0928193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.5 
 
 		 577 aa  87  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  25.4 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0560  hypothetical protein  23.81 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  24.75 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  23.44 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  24.57 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0362  TrkA-C domain protein  24.28 
 
 		 637 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2077  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0449654  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  24.7 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  24.11 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  25 
 
 		 612 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3299  hypothetical protein  26.54 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  29.68 
 
 		 387 aa  51.2  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3867  sodium/hydrogen exchanger  25.86 
 
 		 429 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0872929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0091  sodium/hydrogen exchanger  24.26 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  23.89 
 
 		 610 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  26.54 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3180  TrkA domain-containing protein  24.71 
 
 		 838 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0270  sodium/hydrogen exchanger  22.34 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  25.93 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  25.31 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  26.95 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 400 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  26.95 
 
 		 404 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  26.95 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  25.93 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  24.48 
 
 		 401 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88925  Conserved hypothetical  22.36 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00702791  decreased coverage  0.00000780569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1081  sodium/hydrogen exchanger  23.79 
 
 		 386 aa  45.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4297  TrkA domain-containing protein  22.89 
 
 		 636 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0483  sodium/hydrogen exchanger  27.33 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2107  sodium/hydrogen exchanger  35.17 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.63 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.31 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  23.72 
 
 		 651 aa  42.7  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>