136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1412 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1412  sodium/hydrogen exchanger family protein  100 
 
 		 574 aa  1135    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  33.92 
 
 		 401 aa  193  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1539  sodium/hydrogen exchanger  31.27 
 
 		 398 aa  183  8.000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0928193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.06 
 
 		 577 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  30.5 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  31.84 
 
 		 392 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1689  sodium/hydrogen exchanger  35.44 
 
 		 412 aa  150  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0560  hypothetical protein  28 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 		 391 aa  139  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0091  sodium/hydrogen exchanger  32.04 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0362  TrkA-C domain protein  27.62 
 
 		 637 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3620  sodium/hydrogen exchanger  25.74 
 
 		 412 aa  107  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4297  TrkA domain-containing protein  24.24 
 
 		 636 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3867  sodium/hydrogen exchanger  26.45 
 
 		 429 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0872929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3180  TrkA domain-containing protein  27.43 
 
 		 838 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  26.74 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  25.63 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3065  sodium/hydrogen exchanger  25.57 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  24.57 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  24.57 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  24.57 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  24.26 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  30.04 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  24.59 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  28.65 
 
 		 747 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88925  Conserved hypothetical  23.7 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00702791  decreased coverage  0.00000780569 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2077  sodium/hydrogen exchanger  25.61 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0449654  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0193  sodium/hydrogen exchanger  27.83 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  28.87 
 
 		 715 aa  61.2  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  27.1 
 
 		 582 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  24.07 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1529  sodium/hydrogen exchanger  23 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  31.67 
 
 		 756 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  23.94 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  32.43 
 
 		 764 aa  57.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.58 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  32.82 
 
 		 723 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  31.77 
 
 		 715 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  25.2 
 
 		 395 aa  56.2  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 715 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2353  hypothetical protein  26.47 
 
 		 541 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  23.88 
 
 		 605 aa  53.5  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0270  sodium/hydrogen exchanger  26.23 
 
 		 400 aa  53.5  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3197  sodium/hydrogen exchanger  25.59 
 
 		 391 aa  53.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000344959  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  26.91 
 
 		 773 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  25.55 
 
 		 389 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  32.77 
 
 		 421 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  22.4 
 
 		 404 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 397 aa  52.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  24.86 
 
 		 392 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  24.91 
 
 		 719 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.4 
 
 		 404 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  27.83 
 
 		 771 aa  52.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  22.4 
 
 		 404 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.63 
 
 		 399 aa  52.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  22.4 
 
 		 404 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  22.4 
 
 		 404 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  22.4 
 
 		 404 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  22.4 
 
 		 404 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  23.64 
 
 		 375 aa  52  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  31.4 
 
 		 419 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  25.91 
 
 		 585 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  25.71 
 
 		 617 aa  51.2  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  31.93 
 
 		 419 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  24.75 
 
 		 445 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  24.82 
 
 		 441 aa  50.8  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  25.55 
 
 		 410 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  26.86 
 
 		 396 aa  50.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1547  Sodium/hydrogen exchanger  23.02 
 
 		 402 aa  50.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  30.9 
 
 		 379 aa  50.4  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  24.13 
 
 		 698 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  24.37 
 
 		 392 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  23.42 
 
 		 585 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  21.73 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  23.42 
 
 		 585 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 		 762 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  21.28 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  27.61 
 
 		 767 aa  48.5  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2111  Sodium/hydrogen exchanger  22.66 
 
 		 405 aa  48.5  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0394035  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  26.62 
 
 		 584 aa  48.5  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  25 
 
 		 741 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3866  sodium/hydrogen exchanger  23.7 
 
 		 529 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0286203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  26.01 
 
 		 594 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  24.92 
 
 		 467 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  25.43 
 
 		 423 aa  48.1  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  24.92 
 
 		 467 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  24.77 
 
 		 682 aa  48.1  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  23.56 
 
 		 745 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1212  potassium efflux system protein  24.22 
 
 		 603 aa  47.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212928  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  25.3 
 
 		 413 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  26.42 
 
 		 435 aa  47.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  24.57 
 
 		 388 aa  47.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  23.37 
 
 		 395 aa  47.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  24.1 
 
 		 375 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  23.54 
 
 		 388 aa  47.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  25.15 
 
 		 385 aa  47.4  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  26.07 
 
 		 404 aa  47  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  24.45 
 
 		 722 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>