238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4297 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0362  TrkA-C domain protein  72.68 
 
 		 637 aa  874    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4297  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 636 aa  1243    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3180  TrkA domain-containing protein  43.26 
 
 		 838 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88925  Conserved hypothetical  31.21 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00702791  decreased coverage  0.00000780569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3867  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 		 429 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0872929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 		 401 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0560  hypothetical protein  29.5 
 
 		 399 aa  113  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1689  sodium/hydrogen exchanger  29.79 
 
 		 412 aa  110  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  30.93 
 
 		 620 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 391 aa  107  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  29.7 
 
 		 610 aa  101  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.88 
 
 		 577 aa  93.2  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 617 aa  93.6  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  26.92 
 
 		 628 aa  86.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  27.98 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  23.74 
 
 		 617 aa  84  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1412  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.41 
 
 		 574 aa  82.4  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  21.33 
 
 		 612 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  23.44 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  24.26 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  24.77 
 
 		 626 aa  72.8  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  24.26 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  24.04 
 
 		 630 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  23.57 
 
 		 608 aa  68.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  23.51 
 
 		 611 aa  68.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  23.53 
 
 		 609 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  27.67 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  25.09 
 
 		 609 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.26 
 
 		 609 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.26 
 
 		 609 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  24.26 
 
 		 609 aa  67  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  24.26 
 
 		 609 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.26 
 
 		 609 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.63 
 
 		 609 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.63 
 
 		 609 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.26 
 
 		 609 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0091  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 		 397 aa  66.6  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  32.68 
 
 		 221 aa  67  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  25.46 
 
 		 609 aa  66.6  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.26 
 
 		 609 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  30 
 
 		 221 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  32.03 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  32.89 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  29.94 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  24.54 
 
 		 221 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  24.68 
 
 		 392 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  24.54 
 
 		 221 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  25.37 
 
 		 214 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  25.37 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  30.06 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  27.69 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  27.7 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  24.54 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  24.54 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  24.3 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  26.67 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  24.29 
 
 		 418 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  29.05 
 
 		 452 aa  57  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  31.9 
 
 		 220 aa  56.6  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  25.35 
 
 		 458 aa  57  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  27.49 
 
 		 259 aa  57  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  25.74 
 
 		 222 aa  55.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  27.93 
 
 		 231 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  28.44 
 
 		 227 aa  56.2  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  26.22 
 
 		 458 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  27 
 
 		 385 aa  56.2  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 		 457 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  26.83 
 
 		 218 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  24.32 
 
 		 621 aa  55.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  27.68 
 
 		 457 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  30.38 
 
 		 220 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.68 
 
 		 457 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.68 
 
 		 457 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  28.64 
 
 		 227 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  26.92 
 
 		 457 aa  54.7  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  28 
 
 		 458 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  26.13 
 
 		 458 aa  54.3  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  27.68 
 
 		 457 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  20.56 
 
 		 449 aa  53.9  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4544  potassium transporter peripheral membrane component  27.78 
 
 		 492 aa  54.3  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  29.38 
 
 		 218 aa  53.5  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  25.64 
 
 		 223 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  30.46 
 
 		 218 aa  53.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  28.38 
 
 		 457 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  28.03 
 
 		 134 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  28.57 
 
 		 457 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  25.11 
 
 		 444 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  45.45 
 
 		 539 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  28.03 
 
 		 134 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  28.03 
 
 		 134 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  31.78 
 
 		 137 aa  52.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  27.55 
 
 		 217 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  27.52 
 
 		 457 aa  52.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  25.49 
 
 		 450 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  26.24 
 
 		 220 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  26.63 
 
 		 214 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3620  sodium/hydrogen exchanger  22.44 
 
 		 412 aa  51.6  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  27.4 
 
 		 457 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>