More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1212 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1212  potassium efflux system protein  100 
 
 		 603 aa  1182    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212928  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0186  potassium efflux system protein  62.03 
 
 		 588 aa  649    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0129  potassium efflux system protein  60.82 
 
 		 588 aa  645    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329444 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5903  potassium efflux system protein  59.9 
 
 		 588 aa  634  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455929 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1668  potassium efflux system protein  57.73 
 
 		 610 aa  617  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.228254 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0112  Kef-type K+ transport  57.72 
 
 		 606 aa  581  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.187349  hitchhiker  0.00403769 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4163  potassium efflux system protein  51.65 
 
 		 597 aa  568  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5810  potassium efflux system protein  57.39 
 
 		 610 aa  565  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.408989  normal  0.239098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2368  potassium efflux system protein  57.04 
 
 		 593 aa  552  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3311  glutathione-regulated potassium-proton antiporter  57.78 
 
 		 581 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.254489  normal  0.328099 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1497  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  50.09 
 
 		 601 aa  500  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.363259  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2377  potassium efflux system protein  50 
 
 		 589 aa  497  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0420  potassium efflux system protein  48.95 
 
 		 621 aa  475  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.597186 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0210  glutathione-regulated potassium-efflux system protein, putative  45.19 
 
 		 635 aa  449  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909712  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0904  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  43.72 
 
 		 608 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3041  potassium efflux system protein  45.36 
 
 		 615 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.639601  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0190  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  45.19 
 
 		 614 aa  448  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0528  potassium efflux system protein  46.48 
 
 		 604 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0484  potassium efflux system protein  45.1 
 
 		 604 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0433  potassium efflux system protein  45.61 
 
 		 599 aa  428  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3951  potassium efflux system protein  43.4 
 
 		 657 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.959395 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.7 
 
 		 602 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2592  potassium efflux system protein  44.6 
 
 		 632 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.7 
 
 		 602 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2815  potassium efflux system protein  44.6 
 
 		 632 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.56 
 
 		 602 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.7 
 
 		 602 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2620  potassium efflux system protein  44.41 
 
 		 632 aa  405  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7264  potassium efflux system protein  45.82 
 
 		 630 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6023  potassium efflux system protein  44.99 
 
 		 632 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158915  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1666  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.78 
 
 		 627 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03201  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.53 
 
 		 601 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0148329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0362  potassium efflux system protein  40.37 
 
 		 601 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3725  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.53 
 
 		 601 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03153  hypothetical protein  40.53 
 
 		 601 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156081  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00068  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.62 
 
 		 598 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2542  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.52 
 
 		 605 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3547  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.53 
 
 		 601 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000433295  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0362  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.53 
 
 		 601 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3820  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.53 
 
 		 601 aa  395  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000303842  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3340  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.18 
 
 		 610 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.87 
 
 		 604 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.68 
 
 		 601 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4560  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.5 
 
 		 602 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.460103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.68 
 
 		 601 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.5 
 
 		 601 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3768  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.31 
 
 		 601 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3632  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.27 
 
 		 601 aa  392  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0050352  hitchhiker  0.00031102 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.5 
 
 		 601 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3845  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.84 
 
 		 603 aa  392  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4025  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.17 
 
 		 603 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.68 
 
 		 601 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0872  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.65 
 
 		 635 aa  385  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002286  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  41.04 
 
 		 598 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.56 
 
 		 600 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4703  potassium efflux system protein  43.66 
 
 		 638 aa  381  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829451  normal  0.614792 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  40.14 
 
 		 620 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.14 
 
 		 620 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2361  potassium efflux system protein  40.92 
 
 		 618 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.887492 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.14 
 
 		 620 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.14 
 
 		 620 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.14 
 
 		 620 aa  375  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  37.12 
 
 		 601 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.14 
 
 		 620 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3213  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.87 
 
 		 602 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.14 
 
 		 620 aa  375  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.14 
 
 		 620 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1237  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.22 
 
 		 608 aa  375  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0300  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.17 
 
 		 596 aa  375  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  40.14 
 
 		 620 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  36.94 
 
 		 601 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4400  potassium efflux system protein  43.71 
 
 		 616 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199549  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3376  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.75 
 
 		 604 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  39.82 
 
 		 617 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.32 
 
 		 620 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.32 
 
 		 620 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  40.11 
 
 		 589 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  40.11 
 
 		 589 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  40.11 
 
 		 589 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  39.96 
 
 		 621 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  39.56 
 
 		 589 aa  363  6e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.14 
 
 		 620 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.14 
 
 		 620 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.14 
 
 		 620 aa  362  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3068  potassium efflux system protein  36.93 
 
 		 631 aa  362  8e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  40.18 
 
 		 589 aa  362  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1020  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.04 
 
 		 589 aa  361  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  37.72 
 
 		 628 aa  362  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1236  potassium efflux system protein  38.49 
 
 		 589 aa  359  8e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  37.77 
 
 		 628 aa  358  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0368  potassium efflux system protein  39.96 
 
 		 608 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  38.38 
 
 		 624 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1225  potassium efflux system protein  38.41 
 
 		 642 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.403013  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.35 
 
 		 646 aa  356  5e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4650  potassium efflux system protein  45.5 
 
 		 614 aa  356  5.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143999  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4259  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.07 
 
 		 607 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0003  sodium/hydrogen exchanger  40.65 
 
 		 595 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1980  sodium/hydrogen exchanger  39.2 
 
 		 603 aa  355  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.846503  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2868  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.99 
 
 		 623 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1305  potassium efflux system protein  40.11 
 
 		 589 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00534275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>