More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3845 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03201  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  79.33 
 
 
601 aa  918    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0148329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0362  potassium efflux system protein  79.17 
 
 
601 aa  917    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  58.26 
 
 
600 aa  681    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  81.76 
 
 
604 aa  950    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3820  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  79.33 
 
 
601 aa  917    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000303842  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  81.5 
 
 
602 aa  969    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  77.83 
 
 
601 aa  917    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  81.5 
 
 
602 aa  969    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3725  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  79.17 
 
 
601 aa  915    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03153  hypothetical protein  79.33 
 
 
601 aa  918    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4025  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  98.67 
 
 
603 aa  1186    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3845  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  100 
 
 
603 aa  1199    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0362  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  79.33 
 
 
601 aa  918    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507118  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0300  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  56.49 
 
 
596 aa  645    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  81.5 
 
 
602 aa  969    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3768  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  80.67 
 
 
601 aa  934    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  78 
 
 
601 aa  919    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3632  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  79 
 
 
601 aa  912    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0050352  hitchhiker  0.00031102 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  78 
 
 
601 aa  919    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00068  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  57.29 
 
 
598 aa  664    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4560  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  80.17 
 
 
602 aa  943    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.460103 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002286  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  57.29 
 
 
598 aa  651    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  77.67 
 
 
601 aa  917    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  77.83 
 
 
601 aa  917    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3547  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  79.33 
 
 
601 aa  918    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000433295  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  81.03 
 
 
602 aa  963    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1666  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.75 
 
 
627 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3213  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  46.09 
 
 
602 aa  482  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2542  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.24 
 
 
605 aa  481  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72276  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.61 
 
 
621 aa  481  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  45.2 
 
 
620 aa  474  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.2 
 
 
620 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.2 
 
 
620 aa  474  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  45.2 
 
 
620 aa  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.2 
 
 
620 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.2 
 
 
620 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.37 
 
 
620 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  45.2 
 
 
620 aa  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3376  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.52 
 
 
604 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.2 
 
 
620 aa  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1237  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.53 
 
 
608 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.48 
 
 
617 aa  465  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.58 
 
 
620 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.58 
 
 
620 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.58 
 
 
620 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.58 
 
 
620 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3068  potassium efflux system protein  40.75 
 
 
631 aa  463  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0872  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.67 
 
 
635 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37465  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.41 
 
 
620 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  42.4 
 
 
628 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3340  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.06 
 
 
610 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  42.4 
 
 
628 aa  456  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.84 
 
 
646 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  41.99 
 
 
624 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2060  potassium efflux system protein  42.06 
 
 
619 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0034449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1296  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.13 
 
 
605 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00893714 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  42.66 
 
 
616 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3032  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.35 
 
 
646 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.24 
 
 
632 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2361  potassium efflux system protein  44.58 
 
 
618 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1225  potassium efflux system protein  40.68 
 
 
642 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.403013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2355  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  43.46 
 
 
602 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14064  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  40.27 
 
 
601 aa  445  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  40.27 
 
 
601 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2868  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.57 
 
 
623 aa  443  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  42.5 
 
 
624 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4400  potassium efflux system protein  43.61 
 
 
616 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199549  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2139  potassium efflux system protein  43.12 
 
 
602 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  41.82 
 
 
605 aa  437  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0368  potassium efflux system protein  43.28 
 
 
608 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4259  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  42.61 
 
 
607 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4703  potassium efflux system protein  44.08 
 
 
638 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829451  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5246  potassium efflux system protein  45.42 
 
 
595 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3904  potassium efflux system protein  43.61 
 
 
595 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.738179  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0226  potassium efflux system protein  45.42 
 
 
595 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5156  potassium efflux system protein  45.42 
 
 
595 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.458112 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0406  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  41.18 
 
 
638 aa  428  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0122767  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  40.16 
 
 
652 aa  422  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000096581  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48700  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.53 
 
 
613 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097615 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0086  potassium efflux system protein  40.84 
 
 
633 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05273  hypothetical protein  39.84 
 
 
652 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2548  potassium efflux system protein  41.12 
 
 
662 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5301  potassium efflux system protein  45.08 
 
 
595 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.805136 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2764  potassium efflux system protein  41.98 
 
 
637 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.46 
 
 
613 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0904  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  42.68 
 
 
608 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1347  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  39.1 
 
 
640 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0230885  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2759  potassium efflux system protein  41.34 
 
 
627 aa  415  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3513  potassium efflux system protein  42.86 
 
 
602 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0869039  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0528  potassium efflux system protein  42.78 
 
 
604 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1441  potassium efflux system protein  39.12 
 
 
644 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1486  sodium/hydrogen exchanger  38.97 
 
 
622 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.09304  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0484  potassium efflux system protein  42.63 
 
 
604 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0420  potassium efflux system protein  42.27 
 
 
621 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.597186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1212  potassium efflux system protein  40.27 
 
 
603 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212928  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0111  potassium efflux system protein  39.58 
 
 
636 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000503548  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3041  potassium efflux system protein  42.99 
 
 
615 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.639601  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0186  potassium efflux system protein  43.53 
 
 
588 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1020  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.34 
 
 
589 aa  405  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1668  potassium efflux system protein  43.22 
 
 
610 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.228254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>