More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1020 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1020  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  100 
 
 
589 aa  1179    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  49.31 
 
 
589 aa  552  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  50.53 
 
 
585 aa  554  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  49.14 
 
 
589 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  49.14 
 
 
589 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  48.79 
 
 
589 aa  546  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  48.03 
 
 
589 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1305  potassium efflux system protein  48.03 
 
 
589 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00534275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3045  potassium efflux system protein  47.86 
 
 
589 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.268966  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1236  potassium efflux system protein  48.2 
 
 
589 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1341  potassium efflux system protein  48.37 
 
 
589 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92723  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  43.64 
 
 
628 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  43.64 
 
 
628 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0944  potassium efflux system protein  44.97 
 
 
610 aa  452  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.728384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  43.87 
 
 
624 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.98 
 
 
620 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  40.78 
 
 
620 aa  445  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.81 
 
 
620 aa  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.46 
 
 
617 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  40.98 
 
 
620 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.98 
 
 
620 aa  444  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.98 
 
 
620 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.98 
 
 
620 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.78 
 
 
620 aa  445  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.81 
 
 
620 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  41.55 
 
 
616 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3213  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.11 
 
 
602 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.55 
 
 
600 aa  433  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.08 
 
 
620 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.02 
 
 
621 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  40.23 
 
 
624 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.08 
 
 
620 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.08 
 
 
620 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.25 
 
 
620 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.08 
 
 
620 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3376  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.96 
 
 
604 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1666  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.85 
 
 
627 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.8 
 
 
632 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0872  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.5 
 
 
635 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37465  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2542  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.14 
 
 
605 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72276  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.85 
 
 
602 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.85 
 
 
602 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.03 
 
 
602 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00068  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.49 
 
 
598 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.85 
 
 
602 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4703  potassium efflux system protein  44.76 
 
 
638 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829451  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.17 
 
 
605 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1668  potassium efflux system protein  43.78 
 
 
610 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.228254 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.64 
 
 
646 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.74 
 
 
604 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1237  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.14 
 
 
608 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3340  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.7 
 
 
610 aa  408  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3032  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.13 
 
 
646 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  38.12 
 
 
601 aa  408  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  38.12 
 
 
601 aa  409  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3513  potassium efflux system protein  43.3 
 
 
602 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0869039  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4163  potassium efflux system protein  42.13 
 
 
597 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0300  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.36 
 
 
596 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4560  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.1 
 
 
602 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.460103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0420  potassium efflux system protein  41.58 
 
 
621 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.597186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2139  potassium efflux system protein  43.32 
 
 
602 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002286  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  42.44 
 
 
598 aa  403  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.38 
 
 
613 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48700  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.21 
 
 
613 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5246  potassium efflux system protein  43.99 
 
 
595 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4400  potassium efflux system protein  42.64 
 
 
616 aa  402  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199549  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2361  potassium efflux system protein  40.2 
 
 
618 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5156  potassium efflux system protein  43.81 
 
 
595 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.458112 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03201  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.97 
 
 
601 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0148329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0362  potassium efflux system protein  38.97 
 
 
601 aa  398  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5301  potassium efflux system protein  44.16 
 
 
595 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.805136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2355  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  42.12 
 
 
602 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14064  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4259  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.68 
 
 
607 aa  399  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.44 
 
 
601 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.44 
 
 
601 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2060  potassium efflux system protein  39.39 
 
 
619 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0034449  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03153  hypothetical protein  38.97 
 
 
601 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1486  sodium/hydrogen exchanger  39.05 
 
 
622 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.09304  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3547  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.97 
 
 
601 aa  398  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000433295  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4025  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.59 
 
 
603 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3768  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.05 
 
 
601 aa  396  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517058 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0362  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.97 
 
 
601 aa  398  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507118  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3820  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.97 
 
 
601 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000303842  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3725  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.97 
 
 
601 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202215  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.44 
 
 
601 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.27 
 
 
601 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3845  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.46 
 
 
603 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3632  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.83 
 
 
601 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0050352  hitchhiker  0.00031102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1296  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.89 
 
 
605 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00893714 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1980  sodium/hydrogen exchanger  39.57 
 
 
603 aa  395  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.846503  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.62 
 
 
601 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1225  potassium efflux system protein  39.66 
 
 
642 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.403013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0111  potassium efflux system protein  40.29 
 
 
636 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000503548  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  39.97 
 
 
652 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000096581  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0086  potassium efflux system protein  39.04 
 
 
633 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3068  potassium efflux system protein  37.42 
 
 
631 aa  391  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2868  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.67 
 
 
623 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1862  potassium efflux system protein  40.8 
 
 
623 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.508277  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0433  potassium efflux system protein  40.27 
 
 
599 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1497  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  39.43 
 
 
601 aa  385  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.363259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>