More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0003 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0003  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 595 aa  1157    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2691  sodium/hydrogen exchanger  63.76 
 
 		 581 aa  629  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1803  sodium/hydrogen exchanger  59.45 
 
 		 632 aa  608  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0528  potassium efflux system protein  43.92 
 
 		 604 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0904  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  42.67 
 
 		 608 aa  428  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1668  potassium efflux system protein  43.29 
 
 		 610 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.228254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0484  potassium efflux system protein  42.03 
 
 		 604 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4163  potassium efflux system protein  42.07 
 
 		 597 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0420  potassium efflux system protein  42.17 
 
 		 621 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.597186 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0190  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  41.75 
 
 		 614 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0210  glutathione-regulated potassium-efflux system protein, putative  41.75 
 
 		 635 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909712  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0433  potassium efflux system protein  45.21 
 
 		 599 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2377  potassium efflux system protein  43.44 
 
 		 589 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3041  potassium efflux system protein  40.42 
 
 		 615 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.639601  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1212  potassium efflux system protein  41.44 
 
 		 603 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212928  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.03 
 
 		 601 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.85 
 
 		 601 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.85 
 
 		 601 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.67 
 
 		 601 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.83 
 
 		 604 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.67 
 
 		 601 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03201  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  41.27 
 
 		 601 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0148329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0362  potassium efflux system protein  41.27 
 
 		 601 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.05 
 
 		 602 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3547  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.27 
 
 		 601 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000433295  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.05 
 
 		 602 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3820  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.27 
 
 		 601 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000303842  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.05 
 
 		 602 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03153  hypothetical protein  41.27 
 
 		 601 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156081  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.7 
 
 		 617 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3768  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.95 
 
 		 601 aa  385  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517058 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0362  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.27 
 
 		 601 aa  385  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3725  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.27 
 
 		 601 aa  385  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3632  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.09 
 
 		 601 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0050352  hitchhiker  0.00031102 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5903  potassium efflux system protein  44.42 
 
 		 588 aa  385  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0129  potassium efflux system protein  44.06 
 
 		 588 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329444 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0112  Kef-type K+ transport  43.73 
 
 		 606 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.187349  hitchhiker  0.00403769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0186  potassium efflux system protein  43.76 
 
 		 588 aa  382  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3340  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.63 
 
 		 610 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.71 
 
 		 602 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4560  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.5 
 
 		 602 aa  379  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.460103 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.52 
 
 		 600 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00068  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.91 
 
 		 598 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  36.97 
 
 		 601 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  36.97 
 
 		 601 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.92 
 
 		 621 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  37.06 
 
 		 628 aa  365  1e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.61 
 
 		 620 aa  365  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  38.61 
 
 		 620 aa  365  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3311  glutathione-regulated potassium-proton antiporter  41.29 
 
 		 581 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.254489  normal  0.328099 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.61 
 
 		 620 aa  365  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.61 
 
 		 620 aa  364  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.61 
 
 		 620 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.61 
 
 		 620 aa  363  4e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  38.61 
 
 		 620 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.61 
 
 		 620 aa  363  4e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.61 
 
 		 620 aa  363  4e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5810  potassium efflux system protein  42.73 
 
 		 610 aa  363  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.408989  normal  0.239098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3376  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  39.25 
 
 		 604 aa  362  8e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  38.66 
 
 		 624 aa  362  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  37.79 
 
 		 616 aa  362  2e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.41 
 
 		 620 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  36.59 
 
 		 628 aa  361  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0300  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.43 
 
 		 596 aa  360  4e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.22 
 
 		 620 aa  359  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.22 
 
 		 620 aa  359  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.22 
 
 		 620 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4025  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.38 
 
 		 603 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002286  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  40.92 
 
 		 598 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3951  potassium efflux system protein  41.1 
 
 		 657 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.959395 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.04 
 
 		 620 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1020  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  39.34 
 
 		 589 aa  357  5e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0368  potassium efflux system protein  40.14 
 
 		 608 aa  355  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3213  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  39.85 
 
 		 602 aa  355  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3845  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.02 
 
 		 603 aa  354  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2368  potassium efflux system protein  40.52 
 
 		 593 aa  352  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1666  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  39.22 
 
 		 627 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  39.09 
 
 		 646 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3068  potassium efflux system protein  36.78 
 
 		 631 aa  347  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2542  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  39.78 
 
 		 605 aa  347  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6023  potassium efflux system protein  42.61 
 
 		 632 aa  347  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158915  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1225  potassium efflux system protein  37.72 
 
 		 642 aa  346  7e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.403013  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4703  potassium efflux system protein  40.46 
 
 		 638 aa  346  7e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829451  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2060  potassium efflux system protein  37.5 
 
 		 619 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0034449  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3032  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  39.55 
 
 		 646 aa  345  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  39.56 
 
 		 632 aa  342  8e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  37.08 
 
 		 624 aa  342  9e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1497  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.69 
 
 		 601 aa  342  1e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.363259  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2620  potassium efflux system protein  40.97 
 
 		 632 aa  341  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2815  potassium efflux system protein  41.07 
 
 		 632 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2361  potassium efflux system protein  38.09 
 
 		 618 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2592  potassium efflux system protein  41.07 
 
 		 632 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  35.2 
 
 		 585 aa  340  4e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1862  potassium efflux system protein  38.77 
 
 		 623 aa  340  4e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.508277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1296  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.08 
 
 		 605 aa  340  5e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00893714 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2355  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.82 
 
 		 602 aa  339  7e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14064  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4259  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  39.67 
 
 		 607 aa  339  8e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4400  potassium efflux system protein  41.05 
 
 		 616 aa  339  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199549  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2139  potassium efflux system protein  39.26 
 
 		 602 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2868  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.44 
 
 		 623 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>