65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0002 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  99.75 
 
 
404 aa  795    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  99.75 
 
 
404 aa  795    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  99.75 
 
 
404 aa  795    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  100 
 
 
404 aa  797    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  99.75 
 
 
404 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  85.89 
 
 
404 aa  688    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  86.07 
 
 
404 aa  686    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  99.75 
 
 
404 aa  795    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  85.89 
 
 
404 aa  688    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  85.15 
 
 
451 aa  685    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  85.89 
 
 
404 aa  687    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  96.29 
 
 
404 aa  747    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  86.07 
 
 
404 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  85.15 
 
 
404 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  99.75 
 
 
404 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  76.62 
 
 
400 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  76.87 
 
 
401 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3065  sodium/hydrogen exchanger  74.88 
 
 
400 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  44.53 
 
 
406 aa  345  8.999999999999999e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  43.89 
 
 
418 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  45.02 
 
 
413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  44.53 
 
 
407 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3299  hypothetical protein  43.28 
 
 
407 aa  298  8e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1547  Sodium/hydrogen exchanger  41.6 
 
 
402 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3224  sodium/hydrogen exchanger  40.62 
 
 
417 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0667  hypothetical protein  33.6 
 
 
395 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  32.8 
 
 
395 aa  186  8e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0719  sodium/hydrogen exchanger  32.43 
 
 
420 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3162  hypothetical protein  32.77 
 
 
414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0491  sodium/hydrogen exchanger  31.73 
 
 
423 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0435  sodium/hydrogen exchanger  30.54 
 
 
419 aa  145  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0585  sodium/hydrogen exchanger  31.05 
 
 
420 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270295  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3663  sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 
419 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4469  sodium/hydrogen exchanger  31.55 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.22757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0347  sodium/hydrogen exchanger  29.83 
 
 
421 aa  131  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0980496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0358  sodium/hydrogen exchanger  29.83 
 
 
421 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 
424 aa  130  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2111  Sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0394035  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  24.09 
 
 
404 aa  87.4  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  25.52 
 
 
392 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  23.08 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.62 
 
 
577 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  22.7 
 
 
391 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3867  sodium/hydrogen exchanger  25.45 
 
 
429 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0872929  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  26.6 
 
 
403 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  28.25 
 
 
595 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  26.76 
 
 
597 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1689  sodium/hydrogen exchanger  21.84 
 
 
412 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  23.58 
 
 
662 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  26.79 
 
 
596 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  24.05 
 
 
622 aa  47  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4297  TrkA domain-containing protein  28.33 
 
 
636 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0362  TrkA-C domain protein  28.89 
 
 
637 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 
566 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  31.21 
 
 
598 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  26.84 
 
 
720 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0560  hypothetical protein  23.86 
 
 
399 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  26.47 
 
 
741 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  21.98 
 
 
498 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  27.21 
 
 
551 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  27.21 
 
 
597 aa  43.1  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 
467 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  26.79 
 
 
597 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  28.35 
 
 
598 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 
467 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>