59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3931 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
400 aa  789    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3065  sodium/hydrogen exchanger  87.5 
 
 
400 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  98.25 
 
 
401 aa  781    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  75.62 
 
 
404 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  75.62 
 
 
404 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  75.62 
 
 
404 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  75.12 
 
 
404 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  74.88 
 
 
451 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  76.87 
 
 
404 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  76.87 
 
 
404 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  74.63 
 
 
404 aa  594  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  76.62 
 
 
404 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  76.87 
 
 
404 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  76.37 
 
 
404 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  76.87 
 
 
404 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  76.87 
 
 
404 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  76.87 
 
 
404 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  74.13 
 
 
404 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  47.15 
 
 
406 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  45.77 
 
 
418 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  47 
 
 
413 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  46.25 
 
 
407 aa  328  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3299  hypothetical protein  47 
 
 
407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1547  Sodium/hydrogen exchanger  41.52 
 
 
402 aa  259  8e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3224  sodium/hydrogen exchanger  41.6 
 
 
417 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  32.11 
 
 
395 aa  189  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0667  hypothetical protein  32.47 
 
 
395 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0719  sodium/hydrogen exchanger  34.96 
 
 
420 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3162  hypothetical protein  34.84 
 
 
414 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3663  sodium/hydrogen exchanger  33.7 
 
 
419 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0435  sodium/hydrogen exchanger  32.57 
 
 
419 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0585  sodium/hydrogen exchanger  31.89 
 
 
420 aa  146  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270295  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4469  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
419 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.22757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0347  sodium/hydrogen exchanger  32.23 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0980496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0358  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 
421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0491  sodium/hydrogen exchanger  31.45 
 
 
423 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  28.68 
 
 
424 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2111  Sodium/hydrogen exchanger  28.37 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0394035  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  25.21 
 
 
391 aa  90.5  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  25.46 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  26.16 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  25 
 
 
577 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  21.99 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1412  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.75 
 
 
574 aa  67  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 
414 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1535  sodium/hydrogen exchanger  21.07 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000176128  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2077  sodium/hydrogen exchanger  22.12 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0449654  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  23.14 
 
 
498 aa  51.2  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1689  sodium/hydrogen exchanger  23.14 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3867  sodium/hydrogen exchanger  25.37 
 
 
429 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0872929  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  27.24 
 
 
487 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  28.48 
 
 
483 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  21.74 
 
 
404 aa  43.5  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  26.41 
 
 
597 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  31.37 
 
 
659 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3620  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 
412 aa  43.1  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  24.07 
 
 
467 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  24.07 
 
 
467 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
469 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>