81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1529 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1529  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 503 aa  990    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3197  sodium/hydrogen exchanger  42.97 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000344959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0193  sodium/hydrogen exchanger  42.13 
 
 		 394 aa  280  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2077  sodium/hydrogen exchanger  38.17 
 
 		 394 aa  248  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0449654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0270  sodium/hydrogen exchanger  38.42 
 
 		 400 aa  227  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1535  sodium/hydrogen exchanger  37.01 
 
 		 396 aa  223  8e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000176128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3111  sodium/hydrogen exchanger  38.57 
 
 		 390 aa  203  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000824463  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2353  hypothetical protein  32.52 
 
 		 541 aa  174  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  33.09 
 
 		 543 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2186  Na+/H+-exchanging protein  30.73 
 
 		 545 aa  157  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.601594 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40732  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  26.67 
 
 		 391 aa  97.4  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00131155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2374  hypothetical protein  40.96 
 
 		 97 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.978856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30420  predicted protein  28.48 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.726911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0021  sodium/hydrogen exchanger  24.59 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  24.57 
 
 		 601 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  25.24 
 
 		 608 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  22.57 
 
 		 612 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  25.3 
 
 		 601 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  23.9 
 
 		 637 aa  53.5  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  28.1 
 
 		 727 aa  53.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  24.14 
 
 		 598 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  23.62 
 
 		 651 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.33 
 
 		 655 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  25.95 
 
 		 602 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  22.87 
 
 		 599 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  26.19 
 
 		 716 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  27.48 
 
 		 751 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  24.33 
 
 		 601 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2757  potassium/proton antiporter  25.54 
 
 		 538 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  26.5 
 
 		 716 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  25.63 
 
 		 574 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  25.36 
 
 		 721 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  22.92 
 
 		 581 aa  50.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  22.76 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 		 652 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  24.32 
 
 		 573 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 		 652 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  22.95 
 
 		 392 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  23.87 
 
 		 639 aa  47.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  25.71 
 
 		 611 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  25.71 
 
 		 611 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  22.57 
 
 		 619 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  25.96 
 
 		 599 aa  47.4  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 641 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  23.03 
 
 		 597 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 		 567 aa  47.4  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  22.22 
 
 		 392 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  22.14 
 
 		 610 aa  47.4  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 		 698 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  35.23 
 
 		 712 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  29.09 
 
 		 692 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  26.35 
 
 		 608 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  27.14 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  27.13 
 
 		 698 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  41.18 
 
 		 709 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  25.84 
 
 		 486 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  22.4 
 
 		 392 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  34.45 
 
 		 567 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  22.14 
 
 		 741 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.29 
 
 		 567 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1239  sodium/hydrogen exchanger  31.61 
 
 		 608 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.333753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  24.5 
 
 		 741 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  21.11 
 
 		 611 aa  45.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  27.61 
 
 		 745 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  23.81 
 
 		 732 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  27.4 
 
 		 715 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  25.38 
 
 		 483 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  22.3 
 
 		 445 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2396  sodium/hydrogen exchanger  30.95 
 
 		 355 aa  44.3  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 		 674 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  37.04 
 
 		 663 aa  44.3  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 667 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  32.98 
 
 		 666 aa  43.9  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  22.46 
 
 		 604 aa  43.9  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  35.71 
 
 		 667 aa  43.9  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5829  sodium/hydrogen exchanger  29.52 
 
 		 593 aa  43.5  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626917  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.48 
 
 		 670 aa  43.9  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  30.07 
 
 		 586 aa  43.5  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  19.36 
 
 		 498 aa  43.5  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  28.87 
 
 		 584 aa  43.5  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  22.19 
 
 		 577 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>