More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1239 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1239  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
608 aa  1190    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.333753  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  51.28 
 
 
630 aa  558  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  51.11 
 
 
630 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  53.08 
 
 
594 aa  548  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  51.4 
 
 
629 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  52.48 
 
 
595 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  50.51 
 
 
632 aa  535  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  52.05 
 
 
597 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  44.43 
 
 
591 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  43.87 
 
 
593 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4369  sodium/hydrogen exchanger  42.11 
 
 
592 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1572  sodium/hydrogen exchanger  44.54 
 
 
591 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187931  decreased coverage  0.00050527 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  42.09 
 
 
583 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0454  sodium/hydrogen exchanger  38.1 
 
 
594 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.400108  normal  0.559822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1281  sodium/hydrogen exchanger  38.28 
 
 
594 aa  359  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119428  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  43.69 
 
 
577 aa  355  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1965  sodium/hydrogen exchanger  39.41 
 
 
594 aa  340  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.507467  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0872  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.2 
 
 
635 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37465  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  36.88 
 
 
620 aa  324  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.88 
 
 
620 aa  324  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.88 
 
 
620 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.88 
 
 
620 aa  323  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.88 
 
 
620 aa  323  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  36.88 
 
 
620 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.88 
 
 
620 aa  323  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.7 
 
 
620 aa  323  8e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.61 
 
 
617 aa  322  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.7 
 
 
620 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2542  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.61 
 
 
605 aa  317  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72276  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.54 
 
 
589 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  36.95 
 
 
583 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4566  sodium/hydrogen exchanger  38.56 
 
 
578 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.218526 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.11 
 
 
621 aa  314  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  37.71 
 
 
589 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.35 
 
 
604 aa  312  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  37.37 
 
 
589 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.68 
 
 
600 aa  312  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4259  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.11 
 
 
607 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4560  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.07 
 
 
602 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.460103 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.5 
 
 
602 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  38.96 
 
 
590 aa  311  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.55 
 
 
602 aa  309  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.55 
 
 
602 aa  309  8e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  37.31 
 
 
589 aa  309  8e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  36.86 
 
 
589 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  36.13 
 
 
624 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.68 
 
 
572 aa  308  2.0000000000000002e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  36.25 
 
 
569 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.38 
 
 
602 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.17 
 
 
620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.17 
 
 
620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  36.3 
 
 
628 aa  308  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.17 
 
 
620 aa  308  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.68 
 
 
568 aa  308  3e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.17 
 
 
620 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  36.17 
 
 
628 aa  307  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.99 
 
 
620 aa  306  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00068  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.12 
 
 
598 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1237  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.83 
 
 
608 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.1 
 
 
601 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.1 
 
 
601 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.92 
 
 
601 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.92 
 
 
601 aa  303  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4400  potassium efflux system protein  37.82 
 
 
616 aa  303  8.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199549  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  36.29 
 
 
616 aa  301  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.74 
 
 
601 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3632  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.25 
 
 
601 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0050352  hitchhiker  0.00031102 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03201  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.43 
 
 
601 aa  301  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0148329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0362  potassium efflux system protein  37.43 
 
 
601 aa  301  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1305  potassium efflux system protein  36.86 
 
 
589 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00534275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3547  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.43 
 
 
601 aa  301  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000433295  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03153  hypothetical protein  37.43 
 
 
601 aa  301  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156081  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3045  potassium efflux system protein  36.86 
 
 
589 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.268966  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1236  potassium efflux system protein  37.03 
 
 
589 aa  301  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0362  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.43 
 
 
601 aa  300  5e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507118  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  34.65 
 
 
652 aa  300  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000096581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3768  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.25 
 
 
601 aa  300  6e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517058 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3725  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.43 
 
 
601 aa  300  7e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3820  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.43 
 
 
601 aa  299  8e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000303842  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3845  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.87 
 
 
603 aa  297  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  35.81 
 
 
601 aa  297  4e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  35.81 
 
 
601 aa  297  4e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4025  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.12 
 
 
603 aa  297  5e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1225  potassium efflux system protein  35.02 
 
 
642 aa  296  8e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.403013  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05273  hypothetical protein  32.91 
 
 
652 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1341  potassium efflux system protein  36.86 
 
 
589 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92723  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0210  glutathione-regulated potassium-efflux system protein, putative  36.87 
 
 
635 aa  294  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1020  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.81 
 
 
589 aa  293  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0190  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.87 
 
 
614 aa  293  7e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.75 
 
 
578 aa  293  7e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3376  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.45 
 
 
604 aa  293  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0406  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.93 
 
 
638 aa  292  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0122767  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1666  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.66 
 
 
627 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0944  potassium efflux system protein  37.65 
 
 
610 aa  290  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.728384  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4163  potassium efflux system protein  35.11 
 
 
597 aa  289  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2139  potassium efflux system protein  36.24 
 
 
602 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002286  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  35.57 
 
 
598 aa  289  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  35.83 
 
 
624 aa  289  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  36.73 
 
 
574 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.19 
 
 
605 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>