More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0395 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  100 
 
 
577 aa  1120    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  47.72 
 
 
583 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  45.36 
 
 
629 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  45.08 
 
 
595 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  45.44 
 
 
597 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  45.49 
 
 
591 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  45.47 
 
 
593 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  44.74 
 
 
630 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4369  sodium/hydrogen exchanger  45.42 
 
 
592 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  45.26 
 
 
630 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1239  sodium/hydrogen exchanger  44.15 
 
 
608 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.333753  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  45.52 
 
 
632 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4566  sodium/hydrogen exchanger  45.07 
 
 
578 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.218526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  45.05 
 
 
594 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  45.03 
 
 
590 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  42.45 
 
 
583 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1572  sodium/hydrogen exchanger  47.19 
 
 
591 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187931  decreased coverage  0.00050527 
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  39.14 
 
 
572 aa  363  5.0000000000000005e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  42.2 
 
 
574 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  38.43 
 
 
569 aa  355  2e-96  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.52 
 
 
568 aa  352  1e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.5 
 
 
617 aa  344  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1281  sodium/hydrogen exchanger  38.2 
 
 
594 aa  340  2.9999999999999998e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119428  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.22 
 
 
578 aa  340  4e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.05 
 
 
620 aa  339  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.05 
 
 
620 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  39.31 
 
 
589 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  37.24 
 
 
620 aa  335  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.87 
 
 
620 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.87 
 
 
620 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.24 
 
 
620 aa  335  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.24 
 
 
620 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.24 
 
 
620 aa  334  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.24 
 
 
620 aa  334  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  34.83 
 
 
662 aa  334  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  37.24 
 
 
620 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.24 
 
 
620 aa  335  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.87 
 
 
620 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  39.06 
 
 
533 aa  332  8e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  38.95 
 
 
589 aa  332  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  38.59 
 
 
589 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.89 
 
 
620 aa  331  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  38.76 
 
 
628 aa  330  4e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.77 
 
 
589 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.93 
 
 
600 aa  330  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  38.77 
 
 
589 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1965  sodium/hydrogen exchanger  40.26 
 
 
594 aa  329  7e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.507467  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.82 
 
 
620 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1305  potassium efflux system protein  39.31 
 
 
589 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00534275  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  39.89 
 
 
666 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  39.75 
 
 
663 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  38.41 
 
 
628 aa  326  8.000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3045  potassium efflux system protein  39.13 
 
 
589 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.268966  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  39.54 
 
 
667 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.82 
 
 
621 aa  324  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  39.01 
 
 
667 aa  324  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  39.39 
 
 
663 aa  323  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0872  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.68 
 
 
635 aa  324  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37465  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.56 
 
 
669 aa  323  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  39.56 
 
 
669 aa  323  7e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.56 
 
 
669 aa  323  7e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.56 
 
 
669 aa  323  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.56 
 
 
669 aa  323  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1236  potassium efflux system protein  39.02 
 
 
589 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4259  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  39.12 
 
 
607 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.38 
 
 
669 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  38.31 
 
 
668 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  38.31 
 
 
668 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  38.31 
 
 
668 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  38.14 
 
 
678 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0454  sodium/hydrogen exchanger  37.1 
 
 
594 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.400108  normal  0.559822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2542  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.38 
 
 
605 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72276  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1020  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.58 
 
 
589 aa  320  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.48 
 
 
605 aa  320  6e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.14 
 
 
602 aa  319  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.14 
 
 
602 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.14 
 
 
602 aa  319  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  37.94 
 
 
660 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  37.9 
 
 
668 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  37.78 
 
 
660 aa  318  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1341  potassium efflux system protein  39.31 
 
 
589 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92723  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  40.8 
 
 
658 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  36.76 
 
 
624 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  38.86 
 
 
670 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0300  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.72 
 
 
596 aa  313  3.9999999999999997e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5301  potassium efflux system protein  40.45 
 
 
595 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.805136 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  38.69 
 
 
670 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  37.68 
 
 
616 aa  312  7.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1092  sodium/hydrogen exchanger  40.07 
 
 
642 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163516  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2429  glutathione-regulated potassium-efflux system protein, kefB  40.07 
 
 
642 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.760759  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.03 
 
 
602 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5156  potassium efflux system protein  40.1 
 
 
595 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.458112 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  34.78 
 
 
601 aa  310  4e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5246  potassium efflux system protein  39.93 
 
 
595 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4703  potassium efflux system protein  40.58 
 
 
638 aa  310  5.9999999999999995e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829451  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1225  potassium efflux system protein  37.39 
 
 
642 aa  309  8e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.403013  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3904  potassium efflux system protein  38.04 
 
 
595 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.738179  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  34.78 
 
 
601 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2139  potassium efflux system protein  40 
 
 
602 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  37.74 
 
 
659 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>