More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2845 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  57.68 
 
 
661 aa  703    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  66.77 
 
 
659 aa  822    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  57.16 
 
 
660 aa  735    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  58.07 
 
 
660 aa  732    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  84.11 
 
 
667 aa  1073    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  67.23 
 
 
659 aa  823    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  59.29 
 
 
661 aa  683    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  91.74 
 
 
669 aa  1149    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  58.73 
 
 
680 aa  696    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  91.74 
 
 
669 aa  1149    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  59.97 
 
 
665 aa  685    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  57.35 
 
 
661 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  96.86 
 
 
668 aa  1227    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  55.16 
 
 
652 aa  671    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  67.94 
 
 
659 aa  857    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  91.82 
 
 
663 aa  1149    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  85.76 
 
 
667 aa  1098    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  96.71 
 
 
668 aa  1238    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  91.01 
 
 
663 aa  1144    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  56.97 
 
 
661 aa  650    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  91.74 
 
 
669 aa  1149    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  58.84 
 
 
656 aa  713    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  91.74 
 
 
669 aa  1149    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  59.01 
 
 
664 aa  685    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  85.01 
 
 
666 aa  1079    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  66.46 
 
 
659 aa  804    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  91.74 
 
 
669 aa  1149    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  96.11 
 
 
678 aa  1233    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  67.42 
 
 
674 aa  861    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  57.25 
 
 
661 aa  682    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  97.01 
 
 
668 aa  1229    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  91.74 
 
 
669 aa  1159    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
670 aa  1313    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  99.55 
 
 
670 aa  1306    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  97.01 
 
 
668 aa  1229    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  56.97 
 
 
661 aa  629  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  56.13 
 
 
655 aa  624  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  53.63 
 
 
658 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  52.3 
 
 
661 aa  575  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  52.3 
 
 
661 aa  575  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  39.49 
 
 
662 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  42.27 
 
 
654 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  40.25 
 
 
650 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  40.3 
 
 
666 aa  425  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  38.49 
 
 
654 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  39.24 
 
 
648 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  39.39 
 
 
648 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  39.39 
 
 
648 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  39.54 
 
 
655 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  39.08 
 
 
649 aa  411  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  39.18 
 
 
648 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  37.61 
 
 
720 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  39.88 
 
 
648 aa  405  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  39.66 
 
 
649 aa  405  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  39.35 
 
 
649 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  39.45 
 
 
649 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  39.66 
 
 
648 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  39.66 
 
 
648 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  39.2 
 
 
648 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  37.08 
 
 
657 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  39.24 
 
 
653 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  43.51 
 
 
570 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  39.5 
 
 
648 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  34.8 
 
 
658 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  39.86 
 
 
574 aa  342  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  34.96 
 
 
672 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  36.67 
 
 
583 aa  327  5e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.43 
 
 
697 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  35.17 
 
 
775 aa  324  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  34.15 
 
 
762 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  32.99 
 
 
666 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.84 
 
 
572 aa  314  3.9999999999999997e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  36.24 
 
 
693 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  36.11 
 
 
591 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  32.92 
 
 
674 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  36.87 
 
 
629 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  33.49 
 
 
665 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.59 
 
 
579 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  32.27 
 
 
666 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  33.38 
 
 
664 aa  304  3.0000000000000004e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  37.88 
 
 
594 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  33.58 
 
 
665 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  32.46 
 
 
666 aa  303  5.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  37.22 
 
 
630 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  37.57 
 
 
632 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  37.22 
 
 
630 aa  302  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  33.75 
 
 
771 aa  301  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  36.29 
 
 
533 aa  300  5e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  35.71 
 
 
569 aa  300  7e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  37.41 
 
 
568 aa  300  7e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.71 
 
 
568 aa  299  1e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1380  sodium/hydrogen exchanger  35.63 
 
 
540 aa  298  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.034971  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.83 
 
 
539 aa  298  2e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0907  sodium/hydrogen exchanger  33.15 
 
 
563 aa  298  3e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.04 
 
 
543 aa  296  6e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  34.74 
 
 
593 aa  296  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4369  sodium/hydrogen exchanger  36.67 
 
 
592 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  39.39 
 
 
577 aa  295  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  33.28 
 
 
670 aa  295  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.21 
 
 
578 aa  294  4e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>