More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1965 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1281  sodium/hydrogen exchanger  60.88 
 
 		 594 aa  638    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119428  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0454  sodium/hydrogen exchanger  61.46 
 
 		 594 aa  672    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.400108  normal  0.559822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1965  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 594 aa  1149    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.507467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  43.29 
 
 		 595 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  42.05 
 
 		 630 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  41.52 
 
 		 630 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  40.07 
 
 		 629 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  42.11 
 
 		 632 aa  363  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  42.23 
 
 		 597 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  41.52 
 
 		 594 aa  351  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  38.61 
 
 		 593 aa  351  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1239  sodium/hydrogen exchanger  39.41 
 
 		 608 aa  343  4e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.333753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  39.28 
 
 		 591 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4369  sodium/hydrogen exchanger  38.77 
 
 		 592 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1572  sodium/hydrogen exchanger  39.29 
 
 		 591 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187931  decreased coverage  0.00050527 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  37.73 
 
 		 583 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  40.04 
 
 		 577 aa  312  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  35.86 
 
 		 583 aa  312  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4566  sodium/hydrogen exchanger  40.73 
 
 		 578 aa  303  9e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.218526 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  37.5 
 
 		 590 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  31.76 
 
 		 650 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  32.45 
 
 		 649 aa  279  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  33.04 
 
 		 653 aa  273  7e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  31.74 
 
 		 662 aa  270  4e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 		 649 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  32.57 
 
 		 649 aa  265  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  33.09 
 
 		 602 aa  265  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  33.09 
 
 		 602 aa  264  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  33.09 
 
 		 602 aa  264  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5301  potassium efflux system protein  35.88 
 
 		 595 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805136 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  33.21 
 
 		 648 aa  263  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  33.72 
 
 		 600 aa  263  6.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 		 657 aa  262  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5246  potassium efflux system protein  35.88 
 
 		 595 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  33.88 
 
 		 601 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5156  potassium efflux system protein  35.7 
 
 		 595 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.458112 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  33.88 
 
 		 601 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  33.88 
 
 		 601 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  33.88 
 
 		 601 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  31.96 
 
 		 601 aa  260  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  32.19 
 
 		 601 aa  260  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  32.97 
 
 		 602 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2355  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.9 
 
 		 602 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48700  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.1 
 
 		 613 aa  259  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097615 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  33.88 
 
 		 601 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  32.5 
 
 		 648 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  32.5 
 
 		 648 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  31.87 
 
 		 648 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.1 
 
 		 613 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.02 
 
 		 621 aa  257  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  31.7 
 
 		 648 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4560  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  34.43 
 
 		 602 aa  256  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.460103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2139  potassium efflux system protein  35.53 
 
 		 602 aa  256  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  31.7 
 
 		 648 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  32.33 
 
 		 648 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  32.48 
 
 		 648 aa  254  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  32.87 
 
 		 620 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  32.87 
 
 		 620 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  34.51 
 
 		 574 aa  253  6e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3768  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  34 
 
 		 601 aa  253  8.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  32.48 
 
 		 620 aa  253  9.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  31.87 
 
 		 648 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  31.99 
 
 		 649 aa  253  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  32.87 
 
 		 620 aa  252  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.22 
 
 		 620 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  32.82 
 
 		 620 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  33.22 
 
 		 620 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  33.22 
 
 		 620 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  33.22 
 
 		 620 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  32.28 
 
 		 572 aa  250  5e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  32.73 
 
 		 628 aa  250  5e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.81 
 
 		 671 aa  249  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  32.43 
 
 		 578 aa  248  2e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0226  potassium efflux system protein  35.52 
 
 		 595 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  32.4 
 
 		 654 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  32.03 
 
 		 628 aa  247  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.23 
 
 		 620 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.05 
 
 		 620 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  33.69 
 
 		 620 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  33.09 
 
 		 604 aa  246  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.05 
 
 		 620 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.05 
 
 		 620 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3513  potassium efflux system protein  33.39 
 
 		 602 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0869039  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.06 
 
 		 605 aa  244  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  32.15 
 
 		 616 aa  243  7e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  32.95 
 
 		 533 aa  243  7.999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4163  potassium efflux system protein  30.28 
 
 		 597 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  32.01 
 
 		 659 aa  243  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1441  potassium efflux system protein  31.75 
 
 		 644 aa  241  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03201  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.69 
 
 		 601 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0148329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0362  potassium efflux system protein  34.15 
 
 		 601 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03153  hypothetical protein  33.69 
 
 		 601 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156081  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3547  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  33.69 
 
 		 601 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000433295  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1225  potassium efflux system protein  31.89 
 
 		 642 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.403013  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1020  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.82 
 
 		 589 aa  240  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0362  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  34.15 
 
 		 601 aa  239  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3725  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  33.69 
 
 		 601 aa  239  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3820  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  33.69 
 
 		 601 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000303842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0944  potassium efflux system protein  35.4 
 
 		 610 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.728384  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.28 
 
 		 680 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>