More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5461 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  73.89 
 
 
630 aa  846    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  77.27 
 
 
629 aa  837    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  74.3 
 
 
632 aa  835    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  74.06 
 
 
630 aa  850    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
597 aa  1137    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  91.96 
 
 
595 aa  998    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  57.59 
 
 
594 aa  580  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1239  sodium/hydrogen exchanger  52.05 
 
 
608 aa  550  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.333753  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  49.48 
 
 
593 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  49.47 
 
 
591 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0454  sodium/hydrogen exchanger  43.49 
 
 
594 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.400108  normal  0.559822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4369  sodium/hydrogen exchanger  47.92 
 
 
592 aa  432  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1572  sodium/hydrogen exchanger  49.3 
 
 
591 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187931  decreased coverage  0.00050527 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1281  sodium/hydrogen exchanger  43.84 
 
 
594 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119428  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  45.95 
 
 
583 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  45.79 
 
 
577 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4566  sodium/hydrogen exchanger  45.45 
 
 
578 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.218526 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  39.79 
 
 
583 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1965  sodium/hydrogen exchanger  42.23 
 
 
594 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.507467  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  41.95 
 
 
590 aa  357  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  41.83 
 
 
574 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.87 
 
 
572 aa  346  6e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.59 
 
 
605 aa  345  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.61 
 
 
602 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.61 
 
 
602 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.61 
 
 
602 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  36.92 
 
 
569 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.09 
 
 
568 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  37.32 
 
 
649 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  36.33 
 
 
628 aa  330  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  36.33 
 
 
628 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1980  sodium/hydrogen exchanger  38.65 
 
 
603 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.846503  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  37.61 
 
 
648 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  38.01 
 
 
649 aa  326  9e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  38.29 
 
 
649 aa  324  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4560  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.5 
 
 
602 aa  324  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.460103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  35.84 
 
 
650 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2139  potassium efflux system protein  37.42 
 
 
602 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.65 
 
 
613 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  39.61 
 
 
668 aa  320  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.54 
 
 
654 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  37.15 
 
 
616 aa  319  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  37.79 
 
 
648 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  37.79 
 
 
648 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  37.08 
 
 
648 aa  318  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2355  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.86 
 
 
602 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  34.66 
 
 
662 aa  317  3e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  35.92 
 
 
648 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2542  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.8 
 
 
605 aa  317  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48700  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.47 
 
 
613 aa  317  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097615 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  35.74 
 
 
648 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  35.77 
 
 
620 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.77 
 
 
620 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3768  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.72 
 
 
601 aa  315  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  38.15 
 
 
667 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.2 
 
 
601 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  34.52 
 
 
601 aa  314  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  34.69 
 
 
601 aa  314  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.77 
 
 
620 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  38.35 
 
 
661 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  38.35 
 
 
661 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.77 
 
 
620 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.77 
 
 
620 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.2 
 
 
601 aa  313  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.77 
 
 
620 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  35.77 
 
 
620 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.46 
 
 
621 aa  313  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  36.52 
 
 
589 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.77 
 
 
620 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.2 
 
 
601 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.77 
 
 
620 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  39.08 
 
 
668 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  39.08 
 
 
668 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  39.08 
 
 
668 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  38.4 
 
 
678 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  35.74 
 
 
648 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.2 
 
 
601 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.03 
 
 
601 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  36.01 
 
 
653 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.11 
 
 
602 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.37 
 
 
578 aa  310  4e-83  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0872  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.95 
 
 
635 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37465  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  36.32 
 
 
649 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4259  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.68 
 
 
607 aa  309  8e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  38.5 
 
 
666 aa  309  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.4 
 
 
600 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  39.1 
 
 
663 aa  308  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3845  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.88 
 
 
603 aa  307  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  39.89 
 
 
663 aa  307  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3045  potassium efflux system protein  36.52 
 
 
589 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.268966  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  36.09 
 
 
648 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1305  potassium efflux system protein  36.52 
 
 
589 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00534275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.6 
 
 
669 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  37.15 
 
 
533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  39.6 
 
 
669 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.6 
 
 
669 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.6 
 
 
669 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.6 
 
 
669 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.6 
 
 
669 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1666  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.48 
 
 
627 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>