More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1735 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4369  sodium/hydrogen exchanger  83.14 
 
 		 592 aa  861    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  90.39 
 
 		 591 aa  1001    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1572  sodium/hydrogen exchanger  76.23 
 
 		 591 aa  781    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187931  decreased coverage  0.00050527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 593 aa  1149    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  47.41 
 
 		 630 aa  478  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  49.83 
 
 		 597 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  47.86 
 
 		 632 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  48.79 
 
 		 595 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  47.24 
 
 		 630 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  47.17 
 
 		 629 aa  463  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  44.89 
 
 		 583 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  46.67 
 
 		 594 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1239  sodium/hydrogen exchanger  43.87 
 
 		 608 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.333753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  41.58 
 
 		 583 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1281  sodium/hydrogen exchanger  38.53 
 
 		 594 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119428  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  45.14 
 
 		 577 aa  369  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  42.39 
 
 		 590 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0454  sodium/hydrogen exchanger  36.44 
 
 		 594 aa  348  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.400108  normal  0.559822 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  40.53 
 
 		 574 aa  342  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4566  sodium/hydrogen exchanger  41.13 
 
 		 578 aa  342  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.218526 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1965  sodium/hydrogen exchanger  38.68 
 
 		 594 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.507467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  36.88 
 
 		 650 aa  336  7e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  36.12 
 
 		 601 aa  331  3e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  35.89 
 
 		 601 aa  330  4e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  37.83 
 
 		 648 aa  326  7e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  37.88 
 
 		 533 aa  324  2e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  37.83 
 
 		 648 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  37.65 
 
 		 648 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  37.61 
 
 		 648 aa  324  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  37.33 
 
 		 648 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  34.69 
 
 		 652 aa  321  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  38.18 
 
 		 661 aa  321  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  38.18 
 
 		 661 aa  321  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.18 
 
 		 680 aa  320  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  36.76 
 
 		 648 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  36.76 
 
 		 648 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  34.52 
 
 		 628 aa  317  5e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  35.58 
 
 		 649 aa  316  6e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  35.37 
 
 		 648 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.55 
 
 		 617 aa  314  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  36.78 
 
 		 661 aa  313  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  37.29 
 
 		 648 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  34.35 
 
 		 628 aa  313  6.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  33.16 
 
 		 662 aa  311  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  34.44 
 
 		 649 aa  311  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  34.92 
 
 		 589 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51113  CPA2 family transporter: potassium ion efflux  40.07 
 
 		 593 aa  310  4e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0882446  normal  0.0997387 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  36.12 
 
 		 663 aa  310  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2542  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.88 
 
 		 605 aa  310  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72276  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  35.27 
 
 		 678 aa  310  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  34.92 
 
 		 589 aa  310  5e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  34.92 
 
 		 668 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  37.13 
 
 		 656 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  34.92 
 
 		 668 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  34.92 
 
 		 668 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  34.92 
 
 		 589 aa  309  8e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.11 
 
 		 589 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  36.33 
 
 		 649 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  35.9 
 
 		 669 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1092  sodium/hydrogen exchanger  38.83 
 
 		 642 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2429  glutathione-regulated potassium-efflux system protein, kefB  38.83 
 
 		 642 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.760759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  34.74 
 
 		 668 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  35.67 
 
 		 667 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  33.96 
 
 		 649 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.66 
 
 		 572 aa  306  5.0000000000000004e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  36.08 
 
 		 669 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  36.08 
 
 		 669 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.27 
 
 		 620 aa  306  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  36.08 
 
 		 669 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  36.08 
 
 		 669 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  36.08 
 
 		 669 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  36.08 
 
 		 663 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.85 
 
 		 654 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2355  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.74 
 
 		 602 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  34.59 
 
 		 620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.59 
 
 		 620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.77 
 
 		 620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  36.47 
 
 		 661 aa  305  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  34.92 
 
 		 589 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  35.92 
 
 		 624 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.5 
 
 		 605 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.09 
 
 		 620 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  36.38 
 
 		 666 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.59 
 
 		 620 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.59 
 
 		 620 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  34.59 
 
 		 620 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  37.87 
 
 		 661 aa  303  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.59 
 
 		 620 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.59 
 
 		 620 aa  303  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  35.63 
 
 		 666 aa  303  8.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  37.37 
 
 		 664 aa  303  8.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0300  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.3 
 
 		 596 aa  303  8.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  35.58 
 
 		 660 aa  302  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2139  potassium efflux system protein  38.17 
 
 		 602 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  35.33 
 
 		 667 aa  302  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.42 
 
 		 600 aa  302  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1236  potassium efflux system protein  34.57 
 
 		 589 aa  302  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  34.92 
 
 		 670 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  33.74 
 
 		 616 aa  302  1e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.96 
 
 		 602 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>