More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1943 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  80.34 
 
 
630 aa  882    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  77.74 
 
 
595 aa  822    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  77.27 
 
 
597 aa  807    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  80.51 
 
 
630 aa  883    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  79.39 
 
 
632 aa  843    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
629 aa  1224    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  56.45 
 
 
594 aa  555  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1239  sodium/hydrogen exchanger  51.16 
 
 
608 aa  536  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.333753  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  46.91 
 
 
593 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  46.21 
 
 
591 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0454  sodium/hydrogen exchanger  42.71 
 
 
594 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.400108  normal  0.559822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1281  sodium/hydrogen exchanger  42.61 
 
 
594 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1572  sodium/hydrogen exchanger  46.38 
 
 
591 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187931  decreased coverage  0.00050527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4369  sodium/hydrogen exchanger  45.72 
 
 
592 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  43.76 
 
 
583 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  41.27 
 
 
574 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  45.3 
 
 
577 aa  379  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4566  sodium/hydrogen exchanger  45.26 
 
 
578 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.218526 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  39.62 
 
 
583 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1965  sodium/hydrogen exchanger  40.07 
 
 
594 aa  348  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.507467  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.21 
 
 
602 aa  346  8e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.21 
 
 
602 aa  346  8.999999999999999e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.21 
 
 
602 aa  346  8.999999999999999e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  41.88 
 
 
590 aa  343  5e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.65 
 
 
572 aa  340  2.9999999999999998e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  36.71 
 
 
628 aa  336  7e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  36.71 
 
 
628 aa  335  1e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.3 
 
 
568 aa  330  4e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  35.96 
 
 
569 aa  329  8e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  37.37 
 
 
616 aa  329  9e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4560  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.5 
 
 
602 aa  329  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.460103 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  34.58 
 
 
662 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.58 
 
 
605 aa  326  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.14 
 
 
578 aa  321  1.9999999999999998e-86  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3768  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.82 
 
 
601 aa  321  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517058 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.08 
 
 
602 aa  320  5e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  35.1 
 
 
649 aa  320  5e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  36.25 
 
 
650 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.04 
 
 
601 aa  317  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.87 
 
 
601 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  36.33 
 
 
601 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.72 
 
 
613 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2542  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.35 
 
 
605 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48700  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.54 
 
 
613 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097615 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  35.97 
 
 
601 aa  315  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  37.35 
 
 
668 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.87 
 
 
601 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  36.36 
 
 
648 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.69 
 
 
601 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.87 
 
 
601 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4025  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.15 
 
 
603 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.82 
 
 
600 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3632  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.13 
 
 
601 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0050352  hitchhiker  0.00031102 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03201  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.31 
 
 
601 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0148329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03153  hypothetical protein  37.31 
 
 
601 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156081  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.05 
 
 
617 aa  312  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3547  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.31 
 
 
601 aa  312  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000433295  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0362  potassium efflux system protein  37.31 
 
 
601 aa  311  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3725  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.31 
 
 
601 aa  311  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202215  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51113  CPA2 family transporter: potassium ion efflux  39.1 
 
 
593 aa  311  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0882446  normal  0.0997387 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3820  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.31 
 
 
601 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000303842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0362  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.31 
 
 
601 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507118  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.52 
 
 
654 aa  310  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  37.06 
 
 
649 aa  310  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3213  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.62 
 
 
602 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  36.14 
 
 
648 aa  309  8e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  36.14 
 
 
648 aa  309  8e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3845  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.61 
 
 
603 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00068  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.05 
 
 
598 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  36.41 
 
 
620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  36.3 
 
 
648 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  34.64 
 
 
589 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.41 
 
 
620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  36.64 
 
 
668 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  36.64 
 
 
668 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  36.64 
 
 
668 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  37.17 
 
 
678 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  37.15 
 
 
533 aa  306  6e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4259  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.98 
 
 
607 aa  306  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.41 
 
 
620 aa  306  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.41 
 
 
620 aa  306  8.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  36.41 
 
 
620 aa  306  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.41 
 
 
620 aa  306  8.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.41 
 
 
620 aa  306  8.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.41 
 
 
620 aa  306  9.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.41 
 
 
620 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3376  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.62 
 
 
604 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1980  sodium/hydrogen exchanger  36.17 
 
 
603 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.846503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2355  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.69 
 
 
602 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14064  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  35.61 
 
 
648 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.23 
 
 
680 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2139  potassium efflux system protein  38.73 
 
 
602 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  35.68 
 
 
649 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  35.44 
 
 
648 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.7 
 
 
604 aa  303  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  33.96 
 
 
589 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  37.41 
 
 
663 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  33.96 
 
 
589 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  35.45 
 
 
659 aa  301  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  33.96 
 
 
589 aa  301  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>