More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5097 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  75.33 
 
 
595 aa  829    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  92.88 
 
 
632 aa  1045    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  98.41 
 
 
630 aa  1192    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
630 aa  1211    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  75.53 
 
 
597 aa  823    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  80.48 
 
 
629 aa  899    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  57.07 
 
 
594 aa  567  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1239  sodium/hydrogen exchanger  51.61 
 
 
608 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.333753  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  47.14 
 
 
591 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  46.85 
 
 
593 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1281  sodium/hydrogen exchanger  44.03 
 
 
594 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119428  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  45.62 
 
 
583 aa  418  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0454  sodium/hydrogen exchanger  43.56 
 
 
594 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.400108  normal  0.559822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4369  sodium/hydrogen exchanger  46.03 
 
 
592 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1572  sodium/hydrogen exchanger  46.62 
 
 
591 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187931  decreased coverage  0.00050527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  40 
 
 
583 aa  382  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  45.01 
 
 
577 aa  362  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1965  sodium/hydrogen exchanger  41.52 
 
 
594 aa  362  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.507467  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4566  sodium/hydrogen exchanger  43.51 
 
 
578 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.218526 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  39.97 
 
 
574 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  36.36 
 
 
569 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.19 
 
 
568 aa  342  1e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  41.22 
 
 
590 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  35.54 
 
 
601 aa  336  7e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  35.37 
 
 
601 aa  335  1e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.98 
 
 
572 aa  335  2e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  35.8 
 
 
649 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3213  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  39.16 
 
 
602 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2542  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.8 
 
 
605 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.69 
 
 
605 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  35.49 
 
 
628 aa  325  1e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  35.66 
 
 
628 aa  326  1e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  33.94 
 
 
662 aa  323  7e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4259  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.63 
 
 
607 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  37.52 
 
 
668 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3376  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.65 
 
 
604 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  37.7 
 
 
668 aa  321  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  37.7 
 
 
668 aa  321  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  37.7 
 
 
668 aa  321  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.37 
 
 
602 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.37 
 
 
602 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.37 
 
 
602 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  36.3 
 
 
620 aa  320  6e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.3 
 
 
620 aa  320  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48700  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.57 
 
 
613 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097615 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.23 
 
 
620 aa  319  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.3 
 
 
620 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.01 
 
 
621 aa  318  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.3 
 
 
620 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.3 
 
 
620 aa  318  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  36.3 
 
 
620 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.06 
 
 
620 aa  318  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.23 
 
 
620 aa  318  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1980  sodium/hydrogen exchanger  37.54 
 
 
603 aa  318  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.846503  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  37.99 
 
 
678 aa  318  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.64 
 
 
617 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.9 
 
 
602 aa  316  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.68 
 
 
613 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.81 
 
 
600 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  35.43 
 
 
650 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  37.65 
 
 
533 aa  313  7.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  35.54 
 
 
616 aa  311  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.83 
 
 
620 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.83 
 
 
620 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4560  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.66 
 
 
602 aa  310  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.460103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  37.35 
 
 
670 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.61 
 
 
620 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.99 
 
 
601 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.61 
 
 
620 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  37.35 
 
 
670 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.99 
 
 
601 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.61 
 
 
620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  35.44 
 
 
649 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  36.17 
 
 
667 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.99 
 
 
601 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.99 
 
 
601 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  37.14 
 
 
663 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.81 
 
 
601 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  34.97 
 
 
648 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  37.61 
 
 
669 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.61 
 
 
669 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3768  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.53 
 
 
601 aa  305  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517058 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.61 
 
 
669 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.61 
 
 
669 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00068  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.57 
 
 
598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  35.26 
 
 
648 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  35.26 
 
 
648 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.61 
 
 
669 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  36.89 
 
 
663 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.43 
 
 
669 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.09 
 
 
578 aa  303  8.000000000000001e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  34.96 
 
 
648 aa  302  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  35.35 
 
 
649 aa  302  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3904  potassium efflux system protein  38.91 
 
 
595 aa  301  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.738179  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0186  potassium efflux system protein  38.1 
 
 
588 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.9 
 
 
646 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1666  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.13 
 
 
627 aa  300  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  36.52 
 
 
666 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  36 
 
 
654 aa  299  8e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  37.21 
 
 
659 aa  299  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>