More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1211 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 611 aa  1220    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  43.75 
 
 		 760 aa  511  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  46.09 
 
 		 607 aa  498  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  45.49 
 
 		 569 aa  486  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  45.7 
 
 		 611 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  45.36 
 
 		 611 aa  485  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  44.37 
 
 		 601 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  44.37 
 
 		 608 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  43.31 
 
 		 763 aa  481  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  43.31 
 
 		 764 aa  481  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  42.54 
 
 		 598 aa  475  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  44.37 
 
 		 601 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  43.85 
 
 		 601 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  44.19 
 
 		 602 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  42.88 
 
 		 617 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  45.31 
 
 		 637 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  43.41 
 
 		 619 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  42.13 
 
 		 597 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  44.48 
 
 		 616 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  41.91 
 
 		 599 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  43.48 
 
 		 669 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  46.09 
 
 		 625 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  44.76 
 
 		 616 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  45.24 
 
 		 666 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  43.87 
 
 		 651 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  42.55 
 
 		 599 aa  452  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  43.48 
 
 		 670 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  43.48 
 
 		 673 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  40.54 
 
 		 622 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  43.48 
 
 		 670 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  44.54 
 
 		 660 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  44.54 
 
 		 660 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  44.37 
 
 		 660 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  44.71 
 
 		 660 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  47.04 
 
 		 702 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  44.19 
 
 		 643 aa  438  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  42.98 
 
 		 719 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  44.77 
 
 		 602 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  36.55 
 
 		 604 aa  357  5e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  35.32 
 
 		 596 aa  343  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  38.09 
 
 		 852 aa  341  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.14 
 
 		 596 aa  339  7e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.14 
 
 		 596 aa  339  8e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.14 
 
 		 596 aa  339  9e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.14 
 
 		 596 aa  339  9e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  35.14 
 
 		 596 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.14 
 
 		 596 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  34.48 
 
 		 606 aa  324  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  36.17 
 
 		 625 aa  315  1.9999999999999998e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  32.76 
 
 		 640 aa  288  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 623 aa  284  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  35.44 
 
 		 652 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  35.44 
 
 		 652 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 		 629 aa  253  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  36.07 
 
 		 640 aa  253  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  32.64 
 
 		 607 aa  252  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  30.7 
 
 		 595 aa  250  5e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  35.69 
 
 		 637 aa  250  6e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  34.01 
 
 		 641 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  32.6 
 
 		 584 aa  247  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  35.69 
 
 		 628 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  36.69 
 
 		 741 aa  236  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  32.99 
 
 		 612 aa  234  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  31.6 
 
 		 610 aa  233  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 		 639 aa  231  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  33.59 
 
 		 609 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  33.46 
 
 		 660 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  33.27 
 
 		 620 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  35.03 
 
 		 593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  34.67 
 
 		 407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  27.73 
 
 		 630 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  30.04 
 
 		 617 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  27.34 
 
 		 617 aa  182  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  28.14 
 
 		 626 aa  178  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  34.13 
 
 		 399 aa  176  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  34.86 
 
 		 401 aa  171  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  33.06 
 
 		 399 aa  170  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  34.57 
 
 		 401 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  27.7 
 
 		 628 aa  163  9e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  32.65 
 
 		 421 aa  161  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  33.81 
 
 		 414 aa  160  7e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 402 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  33.82 
 
 		 414 aa  154  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  33.82 
 
 		 414 aa  154  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  33.99 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  28.2 
 
 		 597 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  27.23 
 
 		 596 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  28.06 
 
 		 598 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  28.27 
 
 		 581 aa  121  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  29.82 
 
 		 597 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  29.22 
 
 		 597 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  26.82 
 
 		 597 aa  110  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  27.01 
 
 		 597 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  25.65 
 
 		 581 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  29.22 
 
 		 597 aa  108  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  28.32 
 
 		 577 aa  106  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  26.85 
 
 		 608 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0869  sodium/hydrogen exchanger  27.61 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0702  sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 		 411 aa  105  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  27.66 
 
 		 626 aa  105  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>