More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0869 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0869  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
417 aa  817    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0177  sodium/hydrogen exchanger  95.68 
 
 
417 aa  746    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1734  sodium/hydrogen exchanger  95.2 
 
 
417 aa  733    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.579704 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1585  sodium/hydrogen exchanger  79.62 
 
 
417 aa  614  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0483  sodium/hydrogen exchanger  62.68 
 
 
419 aa  508  1e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0702  sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 
431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.429987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0702  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 
411 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  29.35 
 
 
498 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  27.61 
 
 
611 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  28.25 
 
 
612 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  25.14 
 
 
610 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  26.57 
 
 
619 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  28.49 
 
 
478 aa  102  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  24.13 
 
 
598 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  28.18 
 
 
597 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 
601 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 
406 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 
637 aa  98.6  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  25.63 
 
 
581 aa  97.8  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  25.94 
 
 
601 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 
601 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  24.75 
 
 
599 aa  96.7  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  26.63 
 
 
595 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  26.62 
 
 
617 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  27.86 
 
 
607 aa  94  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  28.53 
 
 
598 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  28.46 
 
 
596 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  26.03 
 
 
572 aa  93.2  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  26.61 
 
 
581 aa  93.2  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  25.94 
 
 
608 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.47 
 
 
598 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  22.77 
 
 
597 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  27.3 
 
 
481 aa  92.8  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 
760 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  27.2 
 
 
580 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  26.59 
 
 
576 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  25.65 
 
 
622 aa  91.3  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  26.01 
 
 
399 aa  90.1  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.86 
 
 
596 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.86 
 
 
596 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  27.64 
 
 
764 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.58 
 
 
596 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  23.58 
 
 
596 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  27.33 
 
 
763 aa  89  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  24.08 
 
 
604 aa  88.6  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.58 
 
 
596 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  23.3 
 
 
596 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  25.8 
 
 
602 aa  87  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  24.51 
 
 
741 aa  87  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  26.92 
 
 
597 aa  87  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.58 
 
 
596 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  28.49 
 
 
597 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  26.42 
 
 
611 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  25.73 
 
 
401 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  27.84 
 
 
597 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  26.42 
 
 
611 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  25.38 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  26.02 
 
 
640 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2757  potassium/proton antiporter  28.79 
 
 
538 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  25.73 
 
 
401 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 
575 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  28.11 
 
 
597 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  27.92 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  24.27 
 
 
637 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  26.04 
 
 
577 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  26.1 
 
 
573 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.76 
 
 
666 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  23.71 
 
 
651 aa  80.1  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  26.17 
 
 
652 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  25.33 
 
 
580 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.35 
 
 
588 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  24.8 
 
 
617 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  26.5 
 
 
573 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  26.72 
 
 
574 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  26.17 
 
 
652 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  25.33 
 
 
580 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  25.33 
 
 
580 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  29.17 
 
 
497 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  24.01 
 
 
670 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  24.01 
 
 
673 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  27.33 
 
 
509 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  26.84 
 
 
582 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  25.56 
 
 
574 aa  78.2  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  27.22 
 
 
486 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  27.95 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  21.16 
 
 
606 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.01 
 
 
669 aa  77  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  25.81 
 
 
577 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  25.15 
 
 
602 aa  77  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  25.94 
 
 
580 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  26.72 
 
 
574 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  26.72 
 
 
574 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  26.18 
 
 
577 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  26.18 
 
 
577 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  26.18 
 
 
577 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  26.18 
 
 
577 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  23.75 
 
 
670 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  25.21 
 
 
576 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  26.04 
 
 
574 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  25.21 
 
 
576 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>