293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0177 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0869  sodium/hydrogen exchanger  95.68 
 
 
417 aa  767    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0177  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
417 aa  811    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1734  sodium/hydrogen exchanger  95.92 
 
 
417 aa  741    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.579704 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1585  sodium/hydrogen exchanger  79.62 
 
 
417 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0483  sodium/hydrogen exchanger  64.35 
 
 
419 aa  511  1e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0702  sodium/hydrogen exchanger  34.19 
 
 
431 aa  182  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.429987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  28.8 
 
 
498 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0702  sodium/hydrogen exchanger  29.76 
 
 
411 aa  116  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  27.76 
 
 
611 aa  113  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  29.17 
 
 
612 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  28.69 
 
 
478 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  25.12 
 
 
610 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  26.01 
 
 
406 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  25.44 
 
 
599 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  26.07 
 
 
619 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  26.2 
 
 
581 aa  98.2  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 
601 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 
601 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 
601 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  25.9 
 
 
595 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  23.27 
 
 
597 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  25.8 
 
 
637 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  27.54 
 
 
607 aa  94  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  26.11 
 
 
576 aa  93.2  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  23.25 
 
 
598 aa  93.2  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  27.5 
 
 
598 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  27.73 
 
 
597 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  25.76 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  25.74 
 
 
608 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  26.32 
 
 
617 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.3 
 
 
598 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  26.61 
 
 
581 aa  90.1  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  28.01 
 
 
596 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  26.35 
 
 
760 aa  89.7  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  24.32 
 
 
604 aa  89.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  27.3 
 
 
481 aa  89.7  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 
741 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  25.48 
 
 
572 aa  89.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  25.5 
 
 
602 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  26.01 
 
 
622 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  26.92 
 
 
580 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  26.65 
 
 
611 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  27.02 
 
 
764 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  26.49 
 
 
611 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  27.02 
 
 
763 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  25.63 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  25.46 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.73 
 
 
596 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.73 
 
 
596 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  26.83 
 
 
640 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  22.73 
 
 
596 aa  84  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  25.84 
 
 
597 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.44 
 
 
596 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.44 
 
 
596 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  25.2 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  24.45 
 
 
651 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.73 
 
 
596 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  28.34 
 
 
597 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  22.44 
 
 
596 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  25.83 
 
 
577 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 
652 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 
652 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.38 
 
 
666 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  24.48 
 
 
637 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2757  potassium/proton antiporter  26.79 
 
 
538 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  24.57 
 
 
574 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  26.45 
 
 
573 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  26.65 
 
 
575 aa  79  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.35 
 
 
588 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  27.95 
 
 
597 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  28.09 
 
 
597 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  25.35 
 
 
602 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  28.93 
 
 
497 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  29.87 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  25.93 
 
 
617 aa  77.4  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  27.89 
 
 
487 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  25.33 
 
 
580 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  26.47 
 
 
577 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  26.47 
 
 
577 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  26.47 
 
 
577 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  26.47 
 
 
577 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  26.47 
 
 
577 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  23.94 
 
 
569 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  24.65 
 
 
670 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  24.65 
 
 
673 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  25.4 
 
 
580 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  25.21 
 
 
608 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 
605 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  25.9 
 
 
574 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  25.9 
 
 
574 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  25.4 
 
 
580 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  25.14 
 
 
573 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  25.4 
 
 
506 aa  74.7  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  26.89 
 
 
491 aa  74.7  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  24.18 
 
 
607 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  25.48 
 
 
574 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.65 
 
 
669 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  25.41 
 
 
630 aa  74.3  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  25.4 
 
 
580 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  20.29 
 
 
606 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>