241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0472 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  100 
 
 
399 aa  763    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  96.74 
 
 
401 aa  694    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  89.7 
 
 
399 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  96.74 
 
 
401 aa  698    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  73.18 
 
 
402 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  72.84 
 
 
421 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  73.86 
 
 
414 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  73.86 
 
 
414 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  69.17 
 
 
414 aa  465  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  67.42 
 
 
421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  40.43 
 
 
652 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  40.43 
 
 
652 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  43.64 
 
 
640 aa  246  6.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  41.91 
 
 
629 aa  243  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  40.11 
 
 
641 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  41.52 
 
 
628 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  39.69 
 
 
639 aa  223  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  40.83 
 
 
593 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  32.45 
 
 
610 aa  189  9e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  37.43 
 
 
637 aa  186  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  36.34 
 
 
741 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  37.04 
 
 
637 aa  182  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  38.75 
 
 
660 aa  182  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  29.74 
 
 
612 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  34.18 
 
 
569 aa  177  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  32.22 
 
 
607 aa  176  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  34.58 
 
 
622 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  34.13 
 
 
611 aa  171  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  35.19 
 
 
651 aa  171  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.83 
 
 
666 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  34.94 
 
 
620 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  34.73 
 
 
670 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  34.73 
 
 
673 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  33.9 
 
 
670 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 
601 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  31.99 
 
 
598 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  32.58 
 
 
601 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.73 
 
 
669 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  37.53 
 
 
616 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  31.4 
 
 
599 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  33 
 
 
601 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  31.64 
 
 
597 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 
599 aa  155  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.52 
 
 
596 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  29.52 
 
 
596 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.52 
 
 
596 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.52 
 
 
596 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.52 
 
 
596 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.16 
 
 
596 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  31.17 
 
 
760 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  30.33 
 
 
619 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  32.58 
 
 
608 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  34.02 
 
 
625 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  28.99 
 
 
596 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.16 
 
 
763 aa  153  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  34.6 
 
 
660 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  34.6 
 
 
660 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  34.6 
 
 
660 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  33.68 
 
 
602 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  35.35 
 
 
719 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  34.6 
 
 
660 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  34.11 
 
 
643 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  31.61 
 
 
764 aa  149  7e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  31.2 
 
 
611 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  30.24 
 
 
602 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  33.43 
 
 
625 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  30.93 
 
 
611 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 
604 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 
616 aa  142  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  29.74 
 
 
617 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  30.61 
 
 
595 aa  139  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  31.63 
 
 
606 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  36.09 
 
 
702 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  31.11 
 
 
626 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  30.97 
 
 
607 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  31.22 
 
 
617 aa  133  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 
623 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  31.58 
 
 
852 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  27.46 
 
 
617 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  28.5 
 
 
630 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  30.7 
 
 
609 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  30.7 
 
 
407 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  29.08 
 
 
628 aa  103  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  29.59 
 
 
640 aa  102  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 
584 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  24.27 
 
 
498 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  27.2 
 
 
597 aa  91.3  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0869  sodium/hydrogen exchanger  25.46 
 
 
417 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 
491 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 
496 aa  83.2  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1734  sodium/hydrogen exchanger  25.99 
 
 
417 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.579704 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  25 
 
 
577 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0177  sodium/hydrogen exchanger  25.99 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 
574 aa  79.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  25.5 
 
 
487 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  26.79 
 
 
572 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  25.34 
 
 
478 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  23.66 
 
 
481 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  26.32 
 
 
597 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>