299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0424 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 852 aa  1667    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  43.52 
 
 		 622 aa  445  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  41.4 
 
 		 598 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  44.56 
 
 		 599 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  40.26 
 
 		 619 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  38.33 
 
 		 637 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  41.57 
 
 		 616 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  39.43 
 
 		 760 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  42.28 
 
 		 607 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  39.83 
 
 		 651 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  42.49 
 
 		 611 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.94 
 
 		 669 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  41.79 
 
 		 601 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  42.15 
 
 		 611 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  40.72 
 
 		 602 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  37.67 
 
 		 597 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  42.24 
 
 		 643 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  39.64 
 
 		 670 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  39.64 
 
 		 673 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  39.12 
 
 		 670 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.29 
 
 		 666 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  41.79 
 
 		 601 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  37.82 
 
 		 616 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  41.58 
 
 		 601 aa  396  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  39.4 
 
 		 702 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  40.46 
 
 		 608 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  40.21 
 
 		 625 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  40.37 
 
 		 604 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  38.92 
 
 		 660 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  38.71 
 
 		 764 aa  386  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  38.79 
 
 		 719 aa  388  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  41.83 
 
 		 602 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  38.75 
 
 		 660 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  38.71 
 
 		 763 aa  385  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  38.92 
 
 		 660 aa  386  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  38.92 
 
 		 660 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  37.04 
 
 		 599 aa  386  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  39.38 
 
 		 617 aa  372  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  38.09 
 
 		 611 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  39.65 
 
 		 640 aa  359  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  38.62 
 
 		 569 aa  354  4e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.38 
 
 		 596 aa  332  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.21 
 
 		 596 aa  331  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.21 
 
 		 596 aa  331  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  34 
 
 		 596 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  33.44 
 
 		 596 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.21 
 
 		 596 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.21 
 
 		 596 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  36.01 
 
 		 607 aa  321  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  34.04 
 
 		 606 aa  318  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  36.12 
 
 		 625 aa  317  7e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  34.44 
 
 		 623 aa  297  5e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  35.44 
 
 		 641 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  39.66 
 
 		 584 aa  261  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  36.45 
 
 		 629 aa  259  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  37 
 
 		 652 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  37 
 
 		 652 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  37.13 
 
 		 609 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  38.33 
 
 		 660 aa  250  8e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  35.09 
 
 		 610 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  30.91 
 
 		 595 aa  244  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  33.55 
 
 		 640 aa  241  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  35.3 
 
 		 628 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  29.51 
 
 		 741 aa  238  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  38.32 
 
 		 637 aa  237  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  35.37 
 
 		 639 aa  235  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  30.81 
 
 		 612 aa  211  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 617 aa  203  9e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  39.55 
 
 		 407 aa  189  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  33.54 
 
 		 620 aa  186  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  38.07 
 
 		 593 aa  182  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  31.72 
 
 		 628 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  30.73 
 
 		 630 aa  179  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  31.14 
 
 		 626 aa  170  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  29.43 
 
 		 617 aa  160  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  36.08 
 
 		 421 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.07 
 
 		 399 aa  132  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  30.54 
 
 		 597 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.79 
 
 		 401 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.91 
 
 		 401 aa  131  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 		 767 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.52 
 
 		 399 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  29.56 
 
 		 596 aa  125  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  33.14 
 
 		 414 aa  124  8e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  34.9 
 
 		 421 aa  124  8e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.51 
 
 		 402 aa  123  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  31.58 
 
 		 592 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  30.43 
 
 		 597 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  30.1 
 
 		 597 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  29.41 
 
 		 598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  29.34 
 
 		 597 aa  111  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  30.32 
 
 		 597 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  30.09 
 
 		 574 aa  103  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  29.79 
 
 		 573 aa  100  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  29.17 
 
 		 576 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  28.61 
 
 		 486 aa  99  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  30.4 
 
 		 581 aa  98.2  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  27.27 
 
 		 506 aa  96.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  29.01 
 
 		 581 aa  96.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  29.35 
 
 		 572 aa  96.3  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>