273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03225 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  100 
 
 
625 aa  1230    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  38.7 
 
 
760 aa  393  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  38.05 
 
 
763 aa  383  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  38.05 
 
 
764 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  37.61 
 
 
651 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  38.59 
 
 
622 aa  363  4e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  35.17 
 
 
637 aa  363  6e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  37.42 
 
 
617 aa  360  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  37.63 
 
 
599 aa  360  6e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  40.15 
 
 
611 aa  359  9e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  40.46 
 
 
611 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  36.68 
 
 
597 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  38.02 
 
 
616 aa  355  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  36.05 
 
 
598 aa  352  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  37.77 
 
 
569 aa  350  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  37.18 
 
 
625 aa  350  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.41 
 
 
666 aa  345  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  39.16 
 
 
602 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  39.35 
 
 
601 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  35.1 
 
 
607 aa  340  5.9999999999999996e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  35.9 
 
 
673 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  35.9 
 
 
670 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  34.94 
 
 
670 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  40.64 
 
 
616 aa  337  5e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  38.77 
 
 
608 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.07 
 
 
669 aa  334  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  34.81 
 
 
599 aa  334  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  35.84 
 
 
611 aa  333  4e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  39.54 
 
 
601 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  37.42 
 
 
702 aa  332  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  39.35 
 
 
601 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  33.81 
 
 
619 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  37.54 
 
 
643 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  37.82 
 
 
719 aa  323  5e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  35.67 
 
 
660 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  35.49 
 
 
660 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  34.45 
 
 
602 aa  321  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  35.48 
 
 
660 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  35.32 
 
 
660 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  36.17 
 
 
604 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  36.12 
 
 
852 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  31.48 
 
 
596 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  31.48 
 
 
596 aa  300  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.81 
 
 
596 aa  299  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.81 
 
 
596 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.81 
 
 
596 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.81 
 
 
596 aa  297  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.81 
 
 
596 aa  296  6e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  32.03 
 
 
606 aa  292  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  35.23 
 
 
628 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  33.27 
 
 
652 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  33.27 
 
 
652 aa  279  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  32.92 
 
 
641 aa  279  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  30.96 
 
 
640 aa  275  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 
623 aa  267  5e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  34.19 
 
 
607 aa  266  7e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 
629 aa  263  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  31.68 
 
 
637 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 
741 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 
639 aa  241  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  36.36 
 
 
660 aa  240  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  30.63 
 
 
610 aa  240  5e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  30.37 
 
 
612 aa  239  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
584 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  30.24 
 
 
595 aa  220  6e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  32.64 
 
 
609 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
620 aa  213  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  27.44 
 
 
640 aa  213  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  28.1 
 
 
617 aa  209  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  31.58 
 
 
626 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  37.29 
 
 
593 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  29.25 
 
 
630 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  29.61 
 
 
617 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  28.66 
 
 
628 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.53 
 
 
399 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.71 
 
 
399 aa  164  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.76 
 
 
401 aa  163  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  31.59 
 
 
421 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.18 
 
 
401 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.1 
 
 
414 aa  156  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.81 
 
 
402 aa  154  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  29.63 
 
 
407 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.34 
 
 
414 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.34 
 
 
414 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.42 
 
 
421 aa  140  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  26.75 
 
 
597 aa  112  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  27.21 
 
 
598 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  26.23 
 
 
596 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  27.03 
 
 
597 aa  104  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  26.88 
 
 
597 aa  101  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  27.14 
 
 
597 aa  99.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  26.51 
 
 
597 aa  100  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  30.29 
 
 
500 aa  97.8  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  29.12 
 
 
499 aa  97.1  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  27.21 
 
 
597 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  26.38 
 
 
626 aa  94.4  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  27.95 
 
 
574 aa  92.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  27.5 
 
 
505 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  25.25 
 
 
498 aa  92  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  30.66 
 
 
498 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.719209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>