More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0021 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0021  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 484 aa  954    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1574  sodium/hydrogen exchanger  32.73 
 
 		 417 aa  170  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00810596 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0895  sodium/hydrogen exchanger  34 
 
 		 420 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1702  sodium/hydrogen exchanger  25.67 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.447443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1304  sodium/hydrogen exchanger  24.24 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  25.9 
 
 		 612 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  25.13 
 
 		 610 aa  103  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  26.08 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  27.27 
 
 		 581 aa  99  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 		 599 aa  98.2  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  27.83 
 
 		 572 aa  94.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  25.99 
 
 		 576 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  27.35 
 
 		 498 aa  95.1  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  24.57 
 
 		 607 aa  94.4  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  26.52 
 
 		 616 aa  94  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  27.86 
 
 		 486 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  23.57 
 
 		 598 aa  93.2  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  25.74 
 
 		 637 aa  92.8  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  28.06 
 
 		 509 aa  90.1  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  28.74 
 
 		 483 aa  90.1  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  24.87 
 
 		 599 aa  90.1  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  23.92 
 
 		 611 aa  89.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  27.43 
 
 		 581 aa  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  27.2 
 
 		 572 aa  87.8  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 		 588 aa  87.4  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  27.04 
 
 		 651 aa  87  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 619 aa  87  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  25 
 
 		 666 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  23.77 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  26.72 
 
 		 485 aa  86.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  27.17 
 
 		 580 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  26.27 
 
 		 608 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  26.76 
 
 		 597 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  24.52 
 
 		 597 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  26.82 
 
 		 610 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  26.3 
 
 		 741 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  26.46 
 
 		 582 aa  84  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  28.43 
 
 		 530 aa  83.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  24 
 
 		 622 aa  83.6  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66380  potassium/proton antiporter  26.93 
 
 		 538 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  23.1 
 
 		 604 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 		 623 aa  82.8  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  24.04 
 
 		 760 aa  83.2  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  24.38 
 
 		 617 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  24.78 
 
 		 576 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  25.21 
 
 		 576 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  24.78 
 
 		 576 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  24.88 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  26.14 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  24.78 
 
 		 576 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  25.24 
 
 		 637 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  26.11 
 
 		 598 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  27.14 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  24.37 
 
 		 639 aa  80.9  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  24.72 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  23.26 
 
 		 602 aa  80.1  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  24.22 
 
 		 601 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  25.34 
 
 		 598 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.16 
 
 		 669 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  25.3 
 
 		 596 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3071  potassium/proton antiporter  25.19 
 
 		 574 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.57549  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  24.54 
 
 		 574 aa  78.2  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  24.3 
 
 		 573 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  23.58 
 
 		 670 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3240  potassium/proton antiporter  25.71 
 
 		 624 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.526693 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  23.92 
 
 		 596 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.92 
 
 		 596 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1930  potassium/proton antiporter  27.93 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.92 
 
 		 596 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.92 
 
 		 596 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.92 
 
 		 596 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3537  potassium/proton antiporter  25.21 
 
 		 624 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.92 
 
 		 596 aa  77  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  23.42 
 
 		 569 aa  77  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  24.57 
 
 		 574 aa  77  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  24.57 
 
 		 574 aa  77  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  23.16 
 
 		 596 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  23.01 
 
 		 670 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  23.01 
 
 		 673 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  25.13 
 
 		 487 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  21.85 
 
 		 595 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  26.11 
 
 		 605 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  23.2 
 
 		 616 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  23.66 
 
 		 763 aa  75.1  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  23.3 
 
 		 625 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  24.57 
 
 		 574 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  26.2 
 
 		 626 aa  74.7  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2757  potassium/proton antiporter  28.4 
 
 		 538 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  25.62 
 
 		 597 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  26.55 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  26.19 
 
 		 719 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  23.66 
 
 		 764 aa  74.3  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  27.76 
 
 		 592 aa  73.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  23.63 
 
 		 608 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  23.08 
 
 		 611 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  25 
 
 		 598 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  25 
 
 		 580 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  25.43 
 
 		 580 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  25.91 
 
 		 602 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  22.9 
 
 		 574 aa  72  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>