64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1535 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1535  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 396 aa  750    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000176128  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2077  sodium/hydrogen exchanger  45.29 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0449654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3111  sodium/hydrogen exchanger  47.84 
 
 		 390 aa  295  9e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000824463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0193  sodium/hydrogen exchanger  40.26 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0270  sodium/hydrogen exchanger  41.84 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3197  sodium/hydrogen exchanger  38.87 
 
 		 391 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000344959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1529  sodium/hydrogen exchanger  37.01 
 
 		 503 aa  223  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  36.12 
 
 		 543 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2353  hypothetical protein  32.76 
 
 		 541 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2186  Na+/H+-exchanging protein  31.22 
 
 		 545 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.601594 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40732  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  30.71 
 
 		 391 aa  140  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00131155 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30420  predicted protein  27.1 
 
 		 328 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.726911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  24.89 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  24.4 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  27.07 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0895  sodium/hydrogen exchanger  24.62 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  30.05 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  22.45 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0560  hypothetical protein  24.58 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.35 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  28.93 
 
 		 741 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 656 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  23.43 
 
 		 597 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  20.54 
 
 		 491 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1574  sodium/hydrogen exchanger  23.84 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00810596 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  22.91 
 
 		 586 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  23.34 
 
 		 741 aa  50.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  22.8 
 
 		 585 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  22.91 
 
 		 586 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  23.73 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  21.68 
 
 		 585 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  23.13 
 
 		 587 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  22.91 
 
 		 586 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  22.29 
 
 		 586 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  26.26 
 
 		 601 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  25.29 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.85 
 
 		 680 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  27.88 
 
 		 667 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1304  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 435 aa  47  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0483  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  22.83 
 
 		 617 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.12 
 
 		 587 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  33.94 
 
 		 533 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  23.28 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  31.25 
 
 		 569 aa  45.4  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  22.55 
 
 		 612 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  24.91 
 
 		 650 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  24.39 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  25.08 
 
 		 527 aa  44.7  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.95 
 
 		 587 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 659 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  30.47 
 
 		 568 aa  44.3  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  22.58 
 
 		 498 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  30.07 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  22.97 
 
 		 710 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  24.91 
 
 		 490 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  29.46 
 
 		 666 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  28.68 
 
 		 667 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  25.48 
 
 		 608 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  36.51 
 
 		 668 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0702  sodium/hydrogen exchanger  21.05 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  22.46 
 
 		 605 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  28.8 
 
 		 661 aa  43.1  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 674 aa  42.7  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>