36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1304 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1304  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
435 aa  875    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0021  sodium/hydrogen exchanger  24.53 
 
 
484 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0895  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 
420 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1574  sodium/hydrogen exchanger  26.25 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1702  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 
399 aa  99.8  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.447443  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  22.68 
 
 
602 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  23.59 
 
 
619 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  24.06 
 
 
611 aa  53.9  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1761  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  24.02 
 
 
534 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286891  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  29.52 
 
 
617 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  25.93 
 
 
637 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  24.73 
 
 
616 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  20.3 
 
 
596 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  24.8 
 
 
741 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  25.88 
 
 
637 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  21.12 
 
 
596 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  20.3 
 
 
596 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  21.12 
 
 
596 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  22.61 
 
 
574 aa  47.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  21.12 
 
 
596 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  20.3 
 
 
596 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  25.47 
 
 
617 aa  47.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  22.52 
 
 
434 aa  47.4  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  24.38 
 
 
406 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1535  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 
396 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000176128  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.07 
 
 
540 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  26.11 
 
 
541 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  23.97 
 
 
651 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  18.27 
 
 
478 aa  45.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  21.37 
 
 
596 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  22.93 
 
 
623 aa  44.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  21.9 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0483  sodium/hydrogen exchanger  22.93 
 
 
419 aa  43.9  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  21.89 
 
 
414 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  26.32 
 
 
607 aa  43.5  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  24.7 
 
 
444 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>