132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0895 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0895  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 420 aa  813    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1574  sodium/hydrogen exchanger  77.16 
 
 		 417 aa  632  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00810596 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0021  sodium/hydrogen exchanger  34 
 
 		 484 aa  160  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1702  sodium/hydrogen exchanger  28.05 
 
 		 399 aa  137  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.447443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1304  sodium/hydrogen exchanger  28.86 
 
 		 435 aa  111  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  24.53 
 
 		 612 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  23.4 
 
 		 611 aa  77.8  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  25.55 
 
 		 623 aa  76.6  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  23.95 
 
 		 760 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  29.24 
 
 		 622 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  25.39 
 
 		 637 aa  71.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  26.45 
 
 		 651 aa  68.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  26.25 
 
 		 604 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  35.15 
 
 		 741 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  25.57 
 
 		 763 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  25.57 
 
 		 764 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  29.76 
 
 		 617 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  25.74 
 
 		 598 aa  63.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  23.98 
 
 		 599 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  23.87 
 
 		 597 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0702  sodium/hydrogen exchanger  22.96 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.429987  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2353  hypothetical protein  37.29 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  26.45 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  34.35 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1535  sodium/hydrogen exchanger  24.62 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000176128  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  22.86 
 
 		 637 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  24.32 
 
 		 599 aa  58.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  23.02 
 
 		 610 aa  57.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  28.31 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  26.77 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 531 aa  57  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  23.75 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  25.12 
 
 		 491 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  28.48 
 
 		 606 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  26.2 
 
 		 477 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  24.39 
 
 		 611 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 		 608 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2186  Na+/H+-exchanging protein  32.06 
 
 		 545 aa  55.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.601594 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 		 616 aa  54.3  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  24.39 
 
 		 611 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  24.9 
 
 		 640 aa  53.9  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0626  Na(+)/H(+) exchanger family protein  26.72 
 
 		 396 aa  53.5  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 		 616 aa  53.1  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2077  sodium/hydrogen exchanger  27.95 
 
 		 394 aa  53.1  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0449654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  26.15 
 
 		 595 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  26.97 
 
 		 715 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 660 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  24.1 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  22.19 
 
 		 602 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 852 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  23.69 
 
 		 607 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  23.78 
 
 		 630 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 460 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  32.23 
 
 		 485 aa  50.8  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  31.52 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.68 
 
 		 596 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 		 601 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  25.68 
 
 		 596 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.15 
 
 		 596 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.68 
 
 		 596 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 		 414 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.68 
 
 		 596 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.15 
 
 		 596 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  25.58 
 
 		 478 aa  50.1  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  27.52 
 
 		 596 aa  49.7  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  23.08 
 
 		 498 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  24.35 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  26.2 
 
 		 573 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  27.14 
 
 		 577 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  24.38 
 
 		 577 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  24.38 
 
 		 577 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  24.38 
 
 		 577 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  24.38 
 
 		 577 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  24.38 
 
 		 577 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  23.78 
 
 		 607 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  26.06 
 
 		 626 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  32.54 
 
 		 716 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  23.83 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.32 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  22.81 
 
 		 497 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  30.95 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  23.45 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  23.19 
 
 		 617 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  22.75 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  20.92 
 
 		 487 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 		 389 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  26.06 
 
 		 486 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.56 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04380  monovalent inorganic cation transporter, putative  24.36 
 
 		 698 aa  47.4  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  23.42 
 
 		 580 aa  47.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  26.54 
 
 		 664 aa  47  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5829  sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 		 593 aa  47  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626917  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 		 641 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  28.05 
 
 		 581 aa  47  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  23.81 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  22.85 
 
 		 531 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 		 619 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  22.16 
 
 		 541 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>