90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1702 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1702  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
399 aa  770    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.447443  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0895  sodium/hydrogen exchanger  28.26 
 
 
420 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1574  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 
417 aa  142  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810596 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0021  sodium/hydrogen exchanger  26.26 
 
 
484 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1304  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 
435 aa  99.8  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  30.17 
 
 
541 aa  66.2  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  23.89 
 
 
581 aa  62.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.39 
 
 
598 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  24.1 
 
 
581 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  24.73 
 
 
574 aa  60.8  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  27.39 
 
 
580 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 
491 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  26.76 
 
 
577 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  26.76 
 
 
577 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  26.76 
 
 
577 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  26.76 
 
 
577 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  26.76 
 
 
577 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1930  potassium/proton antiporter  29.13 
 
 
569 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  25.6 
 
 
597 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  25.16 
 
 
406 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 
573 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  25.61 
 
 
487 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  28 
 
 
605 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  24.58 
 
 
414 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  26.62 
 
 
483 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  25.23 
 
 
577 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  25.36 
 
 
573 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  24.34 
 
 
612 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  23.04 
 
 
602 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  27.59 
 
 
486 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  29.13 
 
 
580 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0560  potassium/proton antiporter  29.05 
 
 
581 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761529  hitchhiker  0.0000000416087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  34.03 
 
 
580 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  25.31 
 
 
588 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  34.03 
 
 
580 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  25.45 
 
 
506 aa  51.2  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  26.19 
 
 
572 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  24.51 
 
 
610 aa  50.8  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 
575 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  32.23 
 
 
580 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1535  sodium/hydrogen exchanger  23.96 
 
 
396 aa  50.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000176128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  24.52 
 
 
492 aa  50.4  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  25.12 
 
 
576 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  32.05 
 
 
580 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1957  potassium/proton antiporter  28.17 
 
 
578 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0260417  normal  0.308586 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1336  potassium/proton antiporter  28.17 
 
 
578 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000106159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1349  potassium/proton antiporter  28.17 
 
 
578 aa  50.1  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.401684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1678  potassium/proton antiporter  28.17 
 
 
578 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113521  normal  0.874424 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2434  potassium/proton antiporter  30.89 
 
 
578 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010009  normal  0.436306 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01176  hypothetical protein  30.89 
 
 
578 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0803034  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2457  sodium/hydrogen exchanger  30.89 
 
 
578 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000399384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01166  potassium/proton antiporter  30.89 
 
 
578 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1294  potassium/proton antiporter  30.89 
 
 
578 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000808232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  24.56 
 
 
623 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  26.89 
 
 
582 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 
498 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66380  potassium/proton antiporter  26.21 
 
 
538 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  22.51 
 
 
477 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  24.06 
 
 
422 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1887  Na+/H+ exchanger family protein  27.59 
 
 
689 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  22.58 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0702  sodium/hydrogen exchanger  23.65 
 
 
431 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.429987  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  25.75 
 
 
575 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0626  Na(+)/H(+) exchanger family protein  22.44 
 
 
396 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.741976  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  26.32 
 
 
580 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  24.15 
 
 
485 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  25.75 
 
 
575 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1529  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 
503 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  24.52 
 
 
572 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2517  potassium/proton antiporter  28.57 
 
 
590 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  23.19 
 
 
611 aa  47  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  26.57 
 
 
505 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  23.68 
 
 
617 aa  46.2  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  25.84 
 
 
570 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  24.51 
 
 
496 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  22.6 
 
 
576 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  22.6 
 
 
576 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  22.6 
 
 
576 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  22.6 
 
 
576 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  26.22 
 
 
509 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  21.89 
 
 
626 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  23.88 
 
 
497 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2757  potassium/proton antiporter  24.64 
 
 
538 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  26.24 
 
 
597 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3583  sodium/hydrogen exchanger  22.07 
 
 
402 aa  43.5  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  25.37 
 
 
610 aa  43.5  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0966  potassium/proton antiporter  26.42 
 
 
596 aa  43.5  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230877  unclonable  0.0000431742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  24.5 
 
 
596 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  25.29 
 
 
481 aa  43.1  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  22.86 
 
 
499 aa  43.1  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>