80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0560 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0560  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  777    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1689  sodium/hydrogen exchanger  33.67 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 		 391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  31.58 
 
 		 401 aa  139  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1412  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.67 
 
 		 574 aa  129  7.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  31.3 
 
 		 577 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 		 404 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  29.8 
 
 		 392 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4297  TrkA domain-containing protein  29.22 
 
 		 636 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0362  TrkA-C domain protein  28.29 
 
 		 637 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1539  sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0928193  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3867  sodium/hydrogen exchanger  25.74 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0872929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0091  sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.1 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  24.82 
 
 		 531 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3180  TrkA domain-containing protein  26.98 
 
 		 838 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  25.6 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  25.36 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1535  sodium/hydrogen exchanger  25.42 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000176128  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3299  hypothetical protein  28.89 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3162  hypothetical protein  27.06 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200774 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  29.76 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 407 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  27.19 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.86 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  23.86 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  23.86 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  23.86 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  23.86 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  23.86 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  23.86 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 741 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  25.65 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  25.3 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  25.37 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  25.37 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  23.54 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  24.32 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  24.45 
 
 		 482 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  23.17 
 
 		 771 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  24.4 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.34 
 
 		 404 aa  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 		 665 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 		 665 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1665  sodium/hydrogen exchanger  28.19 
 
 		 653 aa  49.7  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.91 
 
 		 540 aa  49.3  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  25.09 
 
 		 637 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3620  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158241  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  23.9 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  23.9 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  23.84 
 
 		 764 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  29.47 
 
 		 580 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  25.46 
 
 		 521 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  25.98 
 
 		 741 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  24.74 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.46 
 
 		 587 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  24.74 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  24.74 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  31.48 
 
 		 652 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  24.35 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3224  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  22.88 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0667  hypothetical protein  24.03 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  25.29 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  25.6 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  26.57 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  26.4 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88925  Conserved hypothetical  24.22 
 
 		 469 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00702791  decreased coverage  0.00000780569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  25.16 
 
 		 585 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.22 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.65 
 
 		 579 aa  44.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  27.2 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  27.18 
 
 		 586 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  26.35 
 
 		 775 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  22.45 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  24.61 
 
 		 585 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  24.31 
 
 		 401 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.39 
 
 		 587 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  23.43 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  31.06 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>