58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3169 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3299  hypothetical protein  90.42 
 
 		 407 aa  671    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  97.28 
 
 		 407 aa  739    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 413 aa  801    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  69.68 
 
 		 418 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  68.8 
 
 		 406 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  45.76 
 
 		 451 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  46.29 
 
 		 404 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  47.03 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  46.78 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  46.78 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  46.53 
 
 		 404 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  46.78 
 
 		 404 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  47.13 
 
 		 401 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  45.27 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  45.27 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  45.27 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  45.27 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  45.27 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  45.27 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  45.77 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  47 
 
 		 400 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  45.02 
 
 		 404 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3065  sodium/hydrogen exchanger  47.5 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1547  Sodium/hydrogen exchanger  37.53 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3224  sodium/hydrogen exchanger  36.66 
 
 		 417 aa  179  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0719  sodium/hydrogen exchanger  30.17 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0491  sodium/hydrogen exchanger  29.65 
 
 		 423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3663  sodium/hydrogen exchanger  31.94 
 
 		 419 aa  123  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0435  sodium/hydrogen exchanger  31.22 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2111  Sodium/hydrogen exchanger  28.38 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0394035  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3162  hypothetical protein  32.56 
 
 		 414 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4469  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.22757 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0667  hypothetical protein  27.58 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  27.01 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0358  sodium/hydrogen exchanger  28.12 
 
 		 421 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0347  sodium/hydrogen exchanger  28.12 
 
 		 421 aa  108  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0980496  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0585  sodium/hydrogen exchanger  29.5 
 
 		 420 aa  106  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  23.99 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  23.91 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0560  hypothetical protein  28.57 
 
 		 399 aa  53.5  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  34.05 
 
 		 577 aa  53.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  23.19 
 
 		 665 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  26.22 
 
 		 457 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  22.76 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.43 
 
 		 579 aa  50.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  25.93 
 
 		 662 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  26.4 
 
 		 395 aa  47  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0091  sodium/hydrogen exchanger  27.51 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  30.47 
 
 		 666 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 741 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  24.64 
 
 		 649 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  26.56 
 
 		 682 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  23.77 
 
 		 674 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2077  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 		 394 aa  43.5  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0449654  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  31.67 
 
 		 577 aa  43.1  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  31.25 
 
 		 598 aa  43.5  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>