132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0147 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  100 
 
 		 577 aa  1142    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 		 391 aa  168  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1412  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.24 
 
 		 574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  30.35 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1689  sodium/hydrogen exchanger  29.85 
 
 		 412 aa  157  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 404 aa  134  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0560  hypothetical protein  31.05 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  28.86 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1539  sodium/hydrogen exchanger  26.1 
 
 		 398 aa  103  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0928193  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3867  sodium/hydrogen exchanger  30.33 
 
 		 429 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0872929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4297  TrkA domain-containing protein  27.45 
 
 		 636 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0091  sodium/hydrogen exchanger  31.51 
 
 		 397 aa  87  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2111  Sodium/hydrogen exchanger  28.01 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0394035  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  37.3 
 
 		 591 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0362  TrkA-C domain protein  25.82 
 
 		 637 aa  80.9  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3620  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  29.34 
 
 		 603 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  25.37 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.11 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  27.24 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  32 
 
 		 605 aa  73.9  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.35 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  26.35 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.35 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.35 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.35 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.35 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.35 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  26.93 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3065  sodium/hydrogen exchanger  24.61 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  24.16 
 
 		 608 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  25.19 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  25.19 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  25.19 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  25.12 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  24.63 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  30.67 
 
 		 590 aa  68.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3180  TrkA domain-containing protein  26.23 
 
 		 838 aa  68.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  24.63 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  32.81 
 
 		 603 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  27.95 
 
 		 593 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  27.13 
 
 		 605 aa  64.3  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  26.43 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  26.9 
 
 		 577 aa  62.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  29.37 
 
 		 602 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.41 
 
 		 582 aa  62  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  28.57 
 
 		 605 aa  60.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88925  Conserved hypothetical  29.76 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00702791  decreased coverage  0.00000780569 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  29.69 
 
 		 613 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  26.67 
 
 		 606 aa  57.4  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.69 
 
 		 612 aa  57.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  31.79 
 
 		 605 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  26.1 
 
 		 406 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  29.8 
 
 		 153 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  25.78 
 
 		 631 aa  56.2  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  29.8 
 
 		 153 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  28.68 
 
 		 624 aa  55.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  23.68 
 
 		 615 aa  55.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  28.67 
 
 		 603 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  30 
 
 		 651 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  24.57 
 
 		 395 aa  54.3  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  26.71 
 
 		 164 aa  54.3  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0667  hypothetical protein  24.5 
 
 		 395 aa  53.9  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  27.87 
 
 		 124 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  27.48 
 
 		 863 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  29.84 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.22 
 
 		 580 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  21.09 
 
 		 598 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  25.17 
 
 		 597 aa  52  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  22.22 
 
 		 594 aa  52  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5812  chloride channel core  29.25 
 
 		 634 aa  52  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.45 
 
 		 603 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  28.12 
 
 		 627 aa  50.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 		 225 aa  50.8  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  28.68 
 
 		 628 aa  50.8  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  27.27 
 
 		 379 aa  50.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  30.65 
 
 		 376 aa  50.4  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.95 
 
 		 754 aa  50.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.01 
 
 		 612 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3162  hypothetical protein  25.13 
 
 		 414 aa  49.3  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200774 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1547  Sodium/hydrogen exchanger  24.81 
 
 		 402 aa  48.5  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.34 
 
 		 620 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  27.13 
 
 		 627 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  36.67 
 
 		 340 aa  48.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  28.12 
 
 		 423 aa  48.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  27.11 
 
 		 407 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  29.03 
 
 		 862 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  29.37 
 
 		 309 aa  47.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  28.46 
 
 		 394 aa  47.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  25.41 
 
 		 500 aa  47.8  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  30.83 
 
 		 214 aa  47.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3102  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 		 331 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.711314  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  27.34 
 
 		 579 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1483  Chloride channel core  26.72 
 
 		 628 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  29.6 
 
 		 202 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0435  sodium/hydrogen exchanger  24.68 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  28.17 
 
 		 368 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  29.37 
 
 		 875 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>