38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0491 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0491  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 423 aa  816    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0435  sodium/hydrogen exchanger  67.15 
 
 		 419 aa  534  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0585  sodium/hydrogen exchanger  67.63 
 
 		 420 aa  524  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0358  sodium/hydrogen exchanger  66.11 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0347  sodium/hydrogen exchanger  66.11 
 
 		 421 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0980496  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3663  sodium/hydrogen exchanger  67.49 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4469  sodium/hydrogen exchanger  66.91 
 
 		 419 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.22757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0719  sodium/hydrogen exchanger  61.96 
 
 		 420 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  31.79 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  31.2 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  31.79 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  31.79 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  31.37 
 
 		 451 aa  150  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  30.33 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.59 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.02 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.02 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.02 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.02 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.02 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.02 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  32.02 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  31.7 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  31.45 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  30.71 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  30.34 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 413 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3065  sodium/hydrogen exchanger  31.64 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3224  sodium/hydrogen exchanger  31.62 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3299  hypothetical protein  31.58 
 
 		 407 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  29.72 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1547  Sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 402 aa  123  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0667  hypothetical protein  29.16 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3162  hypothetical protein  29.82 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2111  Sodium/hydrogen exchanger  23.08 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0394035  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 		 424 aa  67  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>