64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0058 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  86.32 
 
 		 404 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  95.79 
 
 		 404 aa  759    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  85.57 
 
 		 404 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  86.32 
 
 		 404 aa  686    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  86.32 
 
 		 404 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  86.07 
 
 		 404 aa  686    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  95.79 
 
 		 404 aa  760    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  86.32 
 
 		 404 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  86.32 
 
 		 404 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  96.04 
 
 		 451 aa  759    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  95.79 
 
 		 404 aa  759    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  99.5 
 
 		 404 aa  801    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 404 aa  802    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  86.32 
 
 		 404 aa  686    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  95.79 
 
 		 404 aa  759    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  73.95 
 
 		 401 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  74.63 
 
 		 400 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3065  sodium/hydrogen exchanger  73.88 
 
 		 400 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  45.95 
 
 		 406 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  46.53 
 
 		 413 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  44.2 
 
 		 418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  45.19 
 
 		 407 aa  328  7e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3299  hypothetical protein  46.62 
 
 		 407 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1547  Sodium/hydrogen exchanger  38.6 
 
 		 402 aa  243  5e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3224  sodium/hydrogen exchanger  40.1 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0667  hypothetical protein  32.02 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  32.28 
 
 		 395 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0719  sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 		 420 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0435  sodium/hydrogen exchanger  34.43 
 
 		 419 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3162  hypothetical protein  32.84 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0491  sodium/hydrogen exchanger  29.52 
 
 		 423 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0585  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3663  sodium/hydrogen exchanger  31.07 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4469  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.22757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  27.98 
 
 		 424 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0358  sodium/hydrogen exchanger  31.39 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0347  sodium/hydrogen exchanger  31.39 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0980496  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2111  Sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0394035  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  25.27 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  22.8 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  23.12 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  23.87 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  23.19 
 
 		 577 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3867  sodium/hydrogen exchanger  25.88 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0872929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1412  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.68 
 
 		 574 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0362  TrkA-C domain protein  31.11 
 
 		 637 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  27.18 
 
 		 597 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  27.71 
 
 		 720 aa  49.7  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0560  hypothetical protein  25.62 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  27.81 
 
 		 595 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  23.79 
 
 		 662 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  23.31 
 
 		 671 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  22.65 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4297  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 636 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  22.65 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  23.68 
 
 		 610 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  23.44 
 
 		 622 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  25.36 
 
 		 596 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  25.86 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  25.93 
 
 		 403 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  25.49 
 
 		 558 aa  45.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1689  sodium/hydrogen exchanger  22.77 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  25.81 
 
 		 551 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>