53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2111 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2111  Sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
405 aa  797    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0394035  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  28.2 
 
 
406 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 
418 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  27.63 
 
 
404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  27.63 
 
 
404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  27.63 
 
 
404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  27.11 
 
 
404 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  27.11 
 
 
404 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  27.11 
 
 
404 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.68 
 
 
404 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.68 
 
 
404 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.68 
 
 
404 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.68 
 
 
404 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.68 
 
 
404 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.68 
 
 
404 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  26.68 
 
 
404 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  28.68 
 
 
413 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  26.84 
 
 
451 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.94 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  28.17 
 
 
407 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  28.37 
 
 
400 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3065  sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 
400 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  27.68 
 
 
401 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3299  hypothetical protein  27.44 
 
 
407 aa  99.8  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1547  Sodium/hydrogen exchanger  28.98 
 
 
402 aa  96.7  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  25.38 
 
 
404 aa  90.5  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 
424 aa  87  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3162  hypothetical protein  27.13 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3224  sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  26.77 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.32 
 
 
577 aa  66.6  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0491  sodium/hydrogen exchanger  23.08 
 
 
423 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0719  sodium/hydrogen exchanger  24.14 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0435  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  22.88 
 
 
392 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  22.73 
 
 
391 aa  63.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  21.99 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1539  sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 
398 aa  58.2  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0928193  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0667  hypothetical protein  21.35 
 
 
395 aa  54.3  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0585  sodium/hydrogen exchanger  23.56 
 
 
420 aa  50.8  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270295  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0347  sodium/hydrogen exchanger  23.36 
 
 
421 aa  50.1  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0980496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0358  sodium/hydrogen exchanger  23.36 
 
 
421 aa  50.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  23.84 
 
 
671 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  23.75 
 
 
682 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0091  sodium/hydrogen exchanger  26.81 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  25.8 
 
 
441 aa  47  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4297  TrkA domain-containing protein  24.69 
 
 
636 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  24.3 
 
 
650 aa  46.6  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  23.34 
 
 
649 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0362  TrkA-C domain protein  24.88 
 
 
637 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1689  sodium/hydrogen exchanger  24.2 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4469  sodium/hydrogen exchanger  26.53 
 
 
419 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.22757 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  23.62 
 
 
650 aa  43.5  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>