55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3494 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3299  hypothetical protein  89.19 
 
 		 407 aa  671    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  97.28 
 
 		 413 aa  743    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 407 aa  788    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  70.3 
 
 		 418 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  69.21 
 
 		 406 aa  558  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  46.17 
 
 		 404 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  46.17 
 
 		 404 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  46.4 
 
 		 404 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  45.68 
 
 		 404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  45.57 
 
 		 451 aa  328  8e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  45.68 
 
 		 404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  45.19 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  46.63 
 
 		 401 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  44.78 
 
 		 404 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  44.78 
 
 		 404 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  44.78 
 
 		 404 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  44.78 
 
 		 404 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  44.78 
 
 		 404 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  44.78 
 
 		 404 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  44.53 
 
 		 404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  44.78 
 
 		 404 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  46.25 
 
 		 400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3065  sodium/hydrogen exchanger  46.25 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1547  Sodium/hydrogen exchanger  37.03 
 
 		 402 aa  227  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3224  sodium/hydrogen exchanger  36.16 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0719  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 		 420 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3663  sodium/hydrogen exchanger  33.15 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0491  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 		 423 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3162  hypothetical protein  33.51 
 
 		 414 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0435  sodium/hydrogen exchanger  31.75 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2111  Sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0394035  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4469  sodium/hydrogen exchanger  30.73 
 
 		 419 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.22757 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0667  hypothetical protein  27.18 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0347  sodium/hydrogen exchanger  28.12 
 
 		 421 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0980496  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  26.33 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0358  sodium/hydrogen exchanger  28.12 
 
 		 421 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0585  sodium/hydrogen exchanger  29.24 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  23.45 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  25.91 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  25.5 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 		 457 aa  54.3  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0560  hypothetical protein  29.17 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  33.51 
 
 		 577 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  23.64 
 
 		 665 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  23.02 
 
 		 662 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0091  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.9 
 
 		 579 aa  47  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  24.06 
 
 		 674 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2077  sodium/hydrogen exchanger  30.19 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0449654  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  22.88 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  28.15 
 
 		 741 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3620  sodium/hydrogen exchanger  23.43 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158241  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  25.78 
 
 		 682 aa  43.1  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>