61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0002 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  96.53 
 
 
404 aa  748    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  85.07 
 
 
404 aa  680    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  85.15 
 
 
404 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  84.65 
 
 
451 aa  680    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  96.53 
 
 
404 aa  748    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  96.53 
 
 
404 aa  748    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  96.29 
 
 
404 aa  747    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  96.53 
 
 
404 aa  748    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  96.53 
 
 
404 aa  748    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  85.15 
 
 
404 aa  683    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  85.57 
 
 
404 aa  681    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  85.15 
 
 
404 aa  683    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  100 
 
 
404 aa  795    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  84.16 
 
 
404 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  96.53 
 
 
404 aa  748    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  76.37 
 
 
400 aa  584  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  75.87 
 
 
401 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3065  sodium/hydrogen exchanger  75.12 
 
 
400 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  45.19 
 
 
406 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  44.64 
 
 
418 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  45.77 
 
 
413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  44.78 
 
 
407 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3299  hypothetical protein  43.78 
 
 
407 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1547  Sodium/hydrogen exchanger  41.1 
 
 
402 aa  259  8e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3224  sodium/hydrogen exchanger  40.36 
 
 
417 aa  212  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0667  hypothetical protein  32.98 
 
 
395 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  32.71 
 
 
395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0719  sodium/hydrogen exchanger  33.09 
 
 
420 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3162  hypothetical protein  33.17 
 
 
414 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0491  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0435  sodium/hydrogen exchanger  30.79 
 
 
419 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0585  sodium/hydrogen exchanger  31.32 
 
 
420 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270295  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3663  sodium/hydrogen exchanger  32.35 
 
 
419 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4469  sodium/hydrogen exchanger  31.47 
 
 
419 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.22757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  28.85 
 
 
424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0358  sodium/hydrogen exchanger  30.07 
 
 
421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0347  sodium/hydrogen exchanger  30.07 
 
 
421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0980496  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2111  Sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0394035  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  24.61 
 
 
404 aa  92.8  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  24.14 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  24.74 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.37 
 
 
577 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  23.24 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3867  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 
429 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0872929  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1689  sodium/hydrogen exchanger  22.89 
 
 
412 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  29.89 
 
 
414 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  28.25 
 
 
595 aa  49.7  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  27.11 
 
 
597 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  23.05 
 
 
622 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  23.58 
 
 
662 aa  49.7  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0362  TrkA-C domain protein  28.89 
 
 
637 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4297  TrkA domain-containing protein  28.96 
 
 
636 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  27.14 
 
 
596 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  25.42 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  30.89 
 
 
566 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  27.22 
 
 
551 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  31.91 
 
 
598 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  24.16 
 
 
467 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  24.16 
 
 
467 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3180  TrkA domain-containing protein  30.06 
 
 
838 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  25.63 
 
 
741 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>