54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3065 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  87.5 
 
 		 400 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3065  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 400 aa  787    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  87 
 
 		 401 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  74.63 
 
 		 404 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  74.63 
 
 		 404 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  74.63 
 
 		 404 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  74.38 
 
 		 451 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  74.13 
 
 		 404 aa  594  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  73.88 
 
 		 404 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  73.38 
 
 		 404 aa  587  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  75.12 
 
 		 404 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  75.12 
 
 		 404 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  75.12 
 
 		 404 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  75.12 
 
 		 404 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  75.12 
 
 		 404 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  75.12 
 
 		 404 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  75.12 
 
 		 404 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  74.88 
 
 		 404 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  48.14 
 
 		 406 aa  359  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  46.77 
 
 		 418 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  47.5 
 
 		 413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  46.25 
 
 		 407 aa  328  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3299  hypothetical protein  46.75 
 
 		 407 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1547  Sodium/hydrogen exchanger  41.27 
 
 		 402 aa  249  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3224  sodium/hydrogen exchanger  41.09 
 
 		 417 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  33.42 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0667  hypothetical protein  33.77 
 
 		 395 aa  193  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0719  sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3663  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3162  hypothetical protein  34.13 
 
 		 414 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0435  sodium/hydrogen exchanger  33.52 
 
 		 419 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0585  sodium/hydrogen exchanger  32.23 
 
 		 420 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4469  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 419 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.22757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0491  sodium/hydrogen exchanger  32.09 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0347  sodium/hydrogen exchanger  30.95 
 
 		 421 aa  129  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0980496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0358  sodium/hydrogen exchanger  30.95 
 
 		 421 aa  129  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  27.95 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2111  Sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0394035  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  25.68 
 
 		 391 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  24.47 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.81 
 
 		 577 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  25.33 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  22.89 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1412  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.83 
 
 		 574 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  22.84 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0560  hypothetical protein  23.6 
 
 		 399 aa  46.6  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  26.13 
 
 		 597 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1535  sodium/hydrogen exchanger  20.88 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000176128  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  26.69 
 
 		 483 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  27.73 
 
 		 497 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1689  sodium/hydrogen exchanger  22.4 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3867  sodium/hydrogen exchanger  24.88 
 
 		 429 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0872929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3620  sodium/hydrogen exchanger  29.11 
 
 		 412 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>