38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0358 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0347  sodium/hydrogen exchanger  99.76 
 
 		 421 aa  807    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0980496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0358  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 421 aa  807    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0435  sodium/hydrogen exchanger  81.15 
 
 		 419 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0585  sodium/hydrogen exchanger  75 
 
 		 420 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0719  sodium/hydrogen exchanger  69.43 
 
 		 420 aa  538  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0491  sodium/hydrogen exchanger  66.11 
 
 		 423 aa  514  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3663  sodium/hydrogen exchanger  69.05 
 
 		 419 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4469  sodium/hydrogen exchanger  68.57 
 
 		 419 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.22757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  31.46 
 
 		 404 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  31.46 
 
 		 404 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  31.39 
 
 		 451 aa  150  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  31.46 
 
 		 404 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  30.98 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  31.71 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  31.39 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  30.9 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1547  Sodium/hydrogen exchanger  31.11 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.83 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.83 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.83 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.83 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.83 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.83 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  29.83 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.07 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  31.59 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3224  sodium/hydrogen exchanger  31.91 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  30.83 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  29.82 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0667  hypothetical protein  29.56 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3065  sodium/hydrogen exchanger  30.11 
 
 		 400 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  27.96 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  28.12 
 
 		 413 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3299  hypothetical protein  28.99 
 
 		 407 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3162  hypothetical protein  31.25 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2111  Sodium/hydrogen exchanger  24.62 
 
 		 405 aa  67  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0394035  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  25.2 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>