39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3663 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3663  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
419 aa  800    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4469  sodium/hydrogen exchanger  83.97 
 
 
419 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.22757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0435  sodium/hydrogen exchanger  71.36 
 
 
419 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0585  sodium/hydrogen exchanger  68.65 
 
 
420 aa  538  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270295  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0491  sodium/hydrogen exchanger  67.49 
 
 
423 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0347  sodium/hydrogen exchanger  68.81 
 
 
421 aa  508  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0980496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0358  sodium/hydrogen exchanger  69.05 
 
 
421 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0719  sodium/hydrogen exchanger  65.24 
 
 
420 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  33.7 
 
 
400 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  33.7 
 
 
401 aa  163  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 
404 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 
404 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 
404 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 
404 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  31.59 
 
 
451 aa  156  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  32.05 
 
 
404 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  32.05 
 
 
404 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3065  sodium/hydrogen exchanger  33.69 
 
 
400 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  32.35 
 
 
406 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  31.95 
 
 
395 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3224  sodium/hydrogen exchanger  34.4 
 
 
417 aa  150  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.18 
 
 
404 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.2 
 
 
404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.2 
 
 
404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.2 
 
 
404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.2 
 
 
404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.2 
 
 
404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.2 
 
 
404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  31.2 
 
 
404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  32.61 
 
 
418 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0667  hypothetical protein  31.43 
 
 
395 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1547  Sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 
402 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  31.64 
 
 
413 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3299  hypothetical protein  33.16 
 
 
407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3162  hypothetical protein  33.62 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2111  Sodium/hydrogen exchanger  23.94 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0394035  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  25.75 
 
 
424 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  28.86 
 
 
595 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>