142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0276 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
401 aa  778    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  35.2 
 
 
404 aa  207  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1689  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 
412 aa  199  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  37.36 
 
 
391 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1412  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.68 
 
 
574 aa  172  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  32.09 
 
 
577 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 
392 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0560  hypothetical protein  31.16 
 
 
399 aa  142  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4297  TrkA domain-containing protein  28.43 
 
 
636 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1539  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0928193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0362  TrkA-C domain protein  29.09 
 
 
637 aa  132  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3180  TrkA domain-containing protein  30.02 
 
 
838 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3867  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 
429 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0872929  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3620  sodium/hydrogen exchanger  29.22 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158241  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0091  sodium/hydrogen exchanger  29.87 
 
 
397 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  25.2 
 
 
451 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  25.66 
 
 
404 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  25.66 
 
 
404 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  25.66 
 
 
404 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  25.4 
 
 
404 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2111  Sodium/hydrogen exchanger  26.87 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0394035  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.61 
 
 
404 aa  87.4  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  24.24 
 
 
404 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  23.69 
 
 
404 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  25.75 
 
 
401 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  22.55 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  26.03 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.55 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  22.55 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  22.55 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  22.55 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  22.55 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  22.55 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1547  Sodium/hydrogen exchanger  26.37 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3065  sodium/hydrogen exchanger  25.27 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88925  Conserved hypothetical  23.08 
 
 
469 aa  72.8  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00702791  decreased coverage  0.00000780569 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  24.3 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  23.16 
 
 
424 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  25.4 
 
 
389 aa  63.9  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  23.16 
 
 
418 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  32.68 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0667  hypothetical protein  23.71 
 
 
395 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  23.48 
 
 
424 aa  60.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  22.72 
 
 
406 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  25.7 
 
 
610 aa  60.1  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2353  hypothetical protein  31.67 
 
 
541 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 
482 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  23.91 
 
 
413 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  24.04 
 
 
396 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  27.88 
 
 
404 aa  58.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3162  hypothetical protein  24.68 
 
 
414 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200774 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  25.22 
 
 
715 aa  57  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  28.27 
 
 
423 aa  57.4  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  30.47 
 
 
444 aa  57  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 
496 aa  57  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  25.96 
 
 
741 aa  56.2  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  22.19 
 
 
495 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  25.37 
 
 
617 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  23.53 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  26.47 
 
 
628 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2077  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 
394 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0449654  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2186  Na+/H+-exchanging protein  30.83 
 
 
545 aa  54.3  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.601594 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 
467 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 
467 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  27.92 
 
 
427 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3197  sodium/hydrogen exchanger  24.72 
 
 
391 aa  53.1  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000344959  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1081  sodium/hydrogen exchanger  25.39 
 
 
386 aa  53.1  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 
710 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  26.32 
 
 
628 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  28.28 
 
 
417 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.28 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1535  sodium/hydrogen exchanger  23.19 
 
 
396 aa  51.2  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000176128  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  21.97 
 
 
612 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1282  sodium/hydrogen exchanger  23.74 
 
 
406 aa  50.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  24.87 
 
 
425 aa  49.7  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2396  sodium/hydrogen exchanger  31.47 
 
 
355 aa  49.7  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  22.73 
 
 
412 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1278  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 
575 aa  49.7  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  27.98 
 
 
389 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A26  Kef-type K+ transport systems, membrane component  28.3 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  23.73 
 
 
654 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4482  sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 
388 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  27.5 
 
 
543 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  25 
 
 
421 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  26.23 
 
 
567 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.22 
 
 
587 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10218  potassium efflux system protein  23.94 
 
 
629 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0270  sodium/hydrogen exchanger  27.69 
 
 
400 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  26.79 
 
 
852 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3299  hypothetical protein  25.45 
 
 
407 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  21.56 
 
 
418 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  26.38 
 
 
567 aa  47  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 
686 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0193  sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 
394 aa  47  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.52 
 
 
596 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  27.39 
 
 
436 aa  46.6  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.16 
 
 
596 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  26.16 
 
 
596 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.16 
 
 
596 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>