More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1278 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1278  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
575 aa  1152    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  31.48 
 
 
674 aa  252  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  32.69 
 
 
682 aa  248  3e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  30.35 
 
 
636 aa  244  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.61 
 
 
663 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  31.17 
 
 
741 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  32.9 
 
 
673 aa  236  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 
773 aa  236  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  31.52 
 
 
665 aa  236  8e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 
666 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  31.37 
 
 
666 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  31.95 
 
 
652 aa  230  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  31.23 
 
 
671 aa  229  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  33.03 
 
 
668 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.3 
 
 
697 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  29.73 
 
 
762 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  31.82 
 
 
577 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  31.05 
 
 
567 aa  225  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.8 
 
 
671 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  31.78 
 
 
665 aa  223  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  30.26 
 
 
775 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  31.34 
 
 
670 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  32.51 
 
 
662 aa  223  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 
657 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 
567 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  31.09 
 
 
656 aa  220  6e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.25 
 
 
567 aa  219  8.999999999999998e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  29.59 
 
 
662 aa  218  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 
666 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  31.6 
 
 
583 aa  217  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  28.73 
 
 
650 aa  217  5.9999999999999996e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 
672 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 
676 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1380  sodium/hydrogen exchanger  27.79 
 
 
540 aa  213  7e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.034971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  29.74 
 
 
650 aa  213  9e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.18 
 
 
588 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 
598 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  28.44 
 
 
661 aa  211  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  28.44 
 
 
661 aa  211  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  29.14 
 
 
771 aa  210  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  27.83 
 
 
664 aa  210  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.92 
 
 
720 aa  209  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  31.79 
 
 
672 aa  209  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  32.9 
 
 
585 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 
693 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 
606 aa  209  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  28.46 
 
 
649 aa  206  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  28.49 
 
 
649 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  29.48 
 
 
567 aa  205  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  30.29 
 
 
606 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  28.73 
 
 
648 aa  203  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  29.8 
 
 
664 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  30.04 
 
 
658 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  30.22 
 
 
649 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  28.39 
 
 
688 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  29.01 
 
 
564 aa  202  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  31.78 
 
 
666 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  28.98 
 
 
654 aa  201  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  29.68 
 
 
562 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  28.33 
 
 
648 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 
678 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  28.41 
 
 
648 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  29.03 
 
 
624 aa  197  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  29.59 
 
 
648 aa  197  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  28.38 
 
 
648 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0814  sodium/hydrogen exchanger  28.22 
 
 
577 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0542248  normal  0.0778993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  28.22 
 
 
648 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  28.41 
 
 
649 aa  195  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  28.41 
 
 
660 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  28.22 
 
 
648 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 
653 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  30.45 
 
 
556 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  29.15 
 
 
684 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  27.48 
 
 
665 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  27.48 
 
 
665 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  28.04 
 
 
660 aa  194  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  28.52 
 
 
648 aa  194  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  28.52 
 
 
648 aa  194  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.31 
 
 
539 aa  194  5e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  31.96 
 
 
457 aa  193  6e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  31.53 
 
 
586 aa  193  8e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.32 
 
 
540 aa  193  9e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  30.92 
 
 
584 aa  192  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  27.88 
 
 
668 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2033  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 
565 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2112  potassium efflux system protein  28.52 
 
 
624 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521521  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  28.66 
 
 
669 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.66 
 
 
669 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  29.69 
 
 
569 aa  192  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  28.66 
 
 
663 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  29.23 
 
 
595 aa  192  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  28.87 
 
 
663 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.66 
 
 
669 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.66 
 
 
669 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.66 
 
 
669 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 
584 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.66 
 
 
669 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  26.82 
 
 
674 aa  191  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  29.24 
 
 
667 aa  190  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  30.25 
 
 
584 aa  190  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>