More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1889 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  756    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  65.08 
 
 		 400 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  37.04 
 
 		 412 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.05 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  39.43 
 
 		 407 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.79 
 
 		 407 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.53 
 
 		 407 aa  246  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.79 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  39.79 
 
 		 407 aa  246  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  40.05 
 
 		 399 aa  245  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.05 
 
 		 399 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.05 
 
 		 399 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.05 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.77 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  39.53 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.77 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.05 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  40.05 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.53 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.05 
 
 		 399 aa  244  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.05 
 
 		 399 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.05 
 
 		 399 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  39.79 
 
 		 399 aa  243  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  39.84 
 
 		 408 aa  226  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  39.48 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  38.56 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  37.59 
 
 		 403 aa  209  5e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  39.5 
 
 		 411 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  31.83 
 
 		 400 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  37.31 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  39.49 
 
 		 394 aa  192  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  38.6 
 
 		 409 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  36.14 
 
 		 414 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  36.8 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  39.05 
 
 		 395 aa  179  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  37.81 
 
 		 436 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  34.44 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  34.55 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.39 
 
 		 386 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  40.11 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  36 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  31.48 
 
 		 585 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  30.95 
 
 		 585 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  30.33 
 
 		 585 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.5 
 
 		 587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.76 
 
 		 587 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  36.64 
 
 		 396 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 		 587 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  30.85 
 
 		 586 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 		 586 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  30.85 
 
 		 586 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  39.24 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 		 586 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  30.71 
 
 		 585 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  31.25 
 
 		 585 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  35.75 
 
 		 388 aa  155  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 		 777 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  40.13 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  29.21 
 
 		 586 aa  151  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  36.79 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  36.54 
 
 		 415 aa  150  6e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  36.77 
 
 		 388 aa  149  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  35.81 
 
 		 399 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  30.47 
 
 		 741 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  36.36 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  36.16 
 
 		 384 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  36.16 
 
 		 384 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  36.19 
 
 		 567 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  34.82 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  35.82 
 
 		 567 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  26.02 
 
 		 745 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  28.08 
 
 		 747 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.07 
 
 		 567 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  32.01 
 
 		 652 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 636 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  28.34 
 
 		 657 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 757 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  27.07 
 
 		 741 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 674 aa  126  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  28.42 
 
 		 664 aa  126  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  28.79 
 
 		 666 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 		 782 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  32.84 
 
 		 671 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  31.3 
 
 		 771 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  30.63 
 
 		 673 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 		 457 aa  123  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 		 598 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  30.06 
 
 		 584 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  28.69 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  29.35 
 
 		 658 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  31.37 
 
 		 710 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 		 666 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  30.29 
 
 		 764 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  31.82 
 
 		 684 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  28.2 
 
 		 664 aa  120  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 667 aa  119  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 		 562 aa  119  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  30.42 
 
 		 583 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 		 656 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>