More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0617 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0617  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 571 aa  1104    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.371034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7792  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC (K(+)/H(+) antiporter)  44.51 
 
 		 509 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0387  sodium/hydrogen exchanger  43.3 
 
 		 565 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  36.41 
 
 		 660 aa  300  4e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  38.4 
 
 		 667 aa  291  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  35.54 
 
 		 660 aa  289  8e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  36.51 
 
 		 668 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  36.51 
 
 		 668 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  36.51 
 
 		 668 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  39.84 
 
 		 663 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  38.75 
 
 		 666 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  36.69 
 
 		 678 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.92 
 
 		 669 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  37.84 
 
 		 667 aa  286  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  37.21 
 
 		 668 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  39.06 
 
 		 663 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.96 
 
 		 669 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  39.96 
 
 		 669 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.96 
 
 		 669 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.96 
 
 		 669 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.96 
 
 		 669 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  36.73 
 
 		 670 aa  283  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  36.73 
 
 		 670 aa  282  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  30.84 
 
 		 662 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  34.34 
 
 		 674 aa  273  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  35.42 
 
 		 658 aa  266  7e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  33.39 
 
 		 659 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  34.66 
 
 		 650 aa  264  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.28 
 
 		 654 aa  263  8e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  33.87 
 
 		 649 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5214  sodium/hydrogen exchanger  35.37 
 
 		 569 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0668054  normal  0.312541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.39 
 
 		 680 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  33.27 
 
 		 661 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  35.38 
 
 		 659 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  32.09 
 
 		 655 aa  253  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  33.77 
 
 		 661 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  33.77 
 
 		 661 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  32.38 
 
 		 656 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  30.85 
 
 		 624 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  30.7 
 
 		 657 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.2 
 
 		 579 aa  248  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  34.49 
 
 		 664 aa  247  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  32.92 
 
 		 649 aa  246  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  32.44 
 
 		 661 aa  246  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.57 
 
 		 540 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  36.22 
 
 		 570 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  33.46 
 
 		 665 aa  243  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.8 
 
 		 543 aa  242  1e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 		 666 aa  242  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  35.2 
 
 		 659 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  35.12 
 
 		 659 aa  239  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  34.13 
 
 		 649 aa  239  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1380  sodium/hydrogen exchanger  29.64 
 
 		 540 aa  238  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.034971  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  32.56 
 
 		 653 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  35.12 
 
 		 655 aa  236  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1067  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.27 
 
 		 541 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000268693  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  32.04 
 
 		 652 aa  234  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  32.05 
 
 		 720 aa  234  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.66 
 
 		 539 aa  234  4.0000000000000004e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  32.49 
 
 		 648 aa  234  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  32.49 
 
 		 648 aa  234  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  28.72 
 
 		 628 aa  233  8.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  32.49 
 
 		 648 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  32.73 
 
 		 630 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  32.98 
 
 		 648 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  32.98 
 
 		 648 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  28.55 
 
 		 628 aa  232  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  33.33 
 
 		 648 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  30.74 
 
 		 624 aa  230  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  32.73 
 
 		 630 aa  230  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  29.07 
 
 		 585 aa  230  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  32.85 
 
 		 613 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  33.33 
 
 		 648 aa  229  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  34.18 
 
 		 595 aa  229  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  32.44 
 
 		 649 aa  229  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  33.1 
 
 		 661 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0776  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.87 
 
 		 541 aa  227  3e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  31.26 
 
 		 654 aa  228  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10218  potassium efflux system protein  28.41 
 
 		 629 aa  226  6e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  33.58 
 
 		 574 aa  226  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48700  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  32.49 
 
 		 613 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.96 
 
 		 620 aa  226  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1092  sodium/hydrogen exchanger  29.96 
 
 		 642 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163516  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  29.96 
 
 		 620 aa  226  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.78 
 
 		 620 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  32.25 
 
 		 648 aa  226  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.96 
 
 		 620 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2429  glutathione-regulated potassium-efflux system protein, kefB  29.96 
 
 		 642 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.760759  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.96 
 
 		 620 aa  226  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.96 
 
 		 620 aa  226  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.96 
 
 		 620 aa  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  29.96 
 
 		 620 aa  226  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 		 583 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  32.57 
 
 		 648 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.78 
 
 		 620 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.95 
 
 		 621 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  31.75 
 
 		 661 aa  224  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  30.29 
 
 		 589 aa  224  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  30.29 
 
 		 589 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3513  potassium efflux system protein  31.81 
 
 		 602 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0869039  normal  0.428685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>