More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0181 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  55.17 
 
 		 660 aa  683    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  56.74 
 
 		 660 aa  694    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  68.82 
 
 		 661 aa  770    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  58.08 
 
 		 659 aa  691    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  59.82 
 
 		 678 aa  724    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  58.71 
 
 		 667 aa  705    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  66.98 
 
 		 661 aa  742    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  58.86 
 
 		 667 aa  714    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  60.69 
 
 		 669 aa  708    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  59.67 
 
 		 670 aa  712    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  58.59 
 
 		 659 aa  680    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  60 
 
 		 659 aa  743    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  60.64 
 
 		 663 aa  708    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  60.69 
 
 		 669 aa  716    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  59.64 
 
 		 668 aa  728    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  60.03 
 
 		 663 aa  708    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  69.23 
 
 		 661 aa  857    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  67.98 
 
 		 656 aa  859    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  67.82 
 
 		 661 aa  805    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  68.83 
 
 		 664 aa  833    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  58.71 
 
 		 666 aa  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  60.69 
 
 		 669 aa  708    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 665 aa  1299    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  60 
 
 		 674 aa  731    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  59.19 
 
 		 668 aa  716    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  74.29 
 
 		 680 aa  924    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  59.19 
 
 		 668 aa  717    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  60.69 
 
 		 669 aa  708    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  60.69 
 
 		 669 aa  708    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  66.98 
 
 		 661 aa  768    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  59.97 
 
 		 670 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  59.19 
 
 		 668 aa  717    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  68.51 
 
 		 661 aa  806    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  60.69 
 
 		 669 aa  708    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  59.64 
 
 		 659 aa  694    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  55.23 
 
 		 652 aa  631  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  52.85 
 
 		 655 aa  589  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  53.59 
 
 		 658 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  49.14 
 
 		 661 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  49.14 
 
 		 661 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  38.55 
 
 		 662 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  40.86 
 
 		 666 aa  431  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  39.22 
 
 		 650 aa  422  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  36.95 
 
 		 654 aa  411  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  41.64 
 
 		 654 aa  412  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  39.97 
 
 		 649 aa  412  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  38.73 
 
 		 648 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  39.09 
 
 		 649 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  37.58 
 
 		 657 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  38.58 
 
 		 648 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  38.58 
 
 		 648 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  39.67 
 
 		 648 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  38.58 
 
 		 648 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.42 
 
 		 655 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  38.28 
 
 		 648 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  39.57 
 
 		 648 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  38.61 
 
 		 648 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  38.61 
 
 		 648 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  38.85 
 
 		 649 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  38.48 
 
 		 653 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  37 
 
 		 720 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  38.39 
 
 		 649 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  41.92 
 
 		 570 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.03 
 
 		 579 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  32.34 
 
 		 666 aa  317  4e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  37.93 
 
 		 568 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.65 
 
 		 572 aa  315  1.9999999999999998e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  36.47 
 
 		 583 aa  314  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  32.94 
 
 		 775 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.13 
 
 		 697 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  33.44 
 
 		 666 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  33.63 
 
 		 672 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 		 674 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  35.17 
 
 		 670 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  32.79 
 
 		 658 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  33.7 
 
 		 666 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  38.66 
 
 		 574 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  39.44 
 
 		 590 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 		 773 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  35.87 
 
 		 591 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  33.74 
 
 		 762 aa  297  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  33.03 
 
 		 771 aa  297  4e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  34.37 
 
 		 568 aa  296  7e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  34.31 
 
 		 569 aa  295  1e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  34.33 
 
 		 664 aa  294  4e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  38.69 
 
 		 594 aa  292  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  35.83 
 
 		 593 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  32.06 
 
 		 665 aa  291  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  34.42 
 
 		 668 aa  287  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  35.42 
 
 		 629 aa  286  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  30.79 
 
 		 656 aa  286  8e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.18 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  33.22 
 
 		 665 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1380  sodium/hydrogen exchanger  32.27 
 
 		 540 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.034971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36 
 
 		 602 aa  282  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.33 
 
 		 602 aa  280  6e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.33 
 
 		 602 aa  280  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0907  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 		 563 aa  279  9e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.15 
 
 		 602 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.48 
 
 		 604 aa  277  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>